Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Vps33aQ9D2N9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Vps33aQ9D2N9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Vps33aQ9D2N9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Vps33aQ9D2N9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Vps33aQ9D2N9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Vps33aQ9D2N9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Vps33aQ9D2N9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Vps33aQ9D2N9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Vps33aQ9D2N9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Vps33aQ9D2N9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Vps33aQ9D2N9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Vps33aQ9D2N9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Vps33aQ9D2N9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
Vps33aQ9D2N9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Vps33aQ9D2N9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Vps33aQ9D2N9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Vps33aQ9D2N9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Vps33aQ9D2N9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Vps33aQ9D2N9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Vps33aQ9D2N9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,84■■■□□ 2,21
Vps33aQ9D2N9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Vps33aQ9D2N9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Vps33aQ9D2N9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Vps33aQ9D2N9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Vps33aQ9D2N9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Vps33aQ9D2N9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Vps33aQ9D2N9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Vps33aQ9D2N9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Vps33aQ9D2N9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Vps33aQ9D2N9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Vps33aQ9D2N9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Vps33aQ9D2N9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Vps33aQ9D2N9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Vps33aQ9D2N9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Vps33aQ9D2N9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Vps33aQ9D2N9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28,66■■■□□ 2,18
Vps33aQ9D2N9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Vps33aQ9D2N9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Vps33aQ9D2N9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Vps33aQ9D2N9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Vps33aQ9D2N9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,62■■■□□ 2,17
Vps33aQ9D2N9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Vps33aQ9D2N9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Vps33aQ9D2N9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Vps33aQ9D2N9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Vps33aQ9D2N9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Vps33aQ9D2N9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,56■■■□□ 2,16
Vps33aQ9D2N9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Vps33aQ9D2N9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Vps33aQ9D2N9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Vps33aQ9D2N9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Vps33aQ9D2N9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Vps33aQ9D2N9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
Vps33aQ9D2N9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Vps33aQ9D2N9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Vps33aQ9D2N9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Vps33aQ9D2N9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Vps33aQ9D2N9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Vps33aQ9D2N9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Vps33aQ9D2N9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,39■■■□□ 2,13
Vps33aQ9D2N9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Vps33aQ9D2N9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Vps33aQ9D2N9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Vps33aQ9D2N9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Vps33aQ9D2N9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Vps33aQ9D2N9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Vps33aQ9D2N9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Vps33aQ9D2N9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Vps33aQ9D2N9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Vps33aQ9D2N9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Vps33aQ9D2N9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Vps33aQ9D2N9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Vps33aQ9D2N9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Vps33aQ9D2N9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Vps33aQ9D2N9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Vps33aQ9D2N9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Vps33aQ9D2N9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Vps33aQ9D2N9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Vps33aQ9D2N9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Vps33aQ9D2N9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Vps33aQ9D2N9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Vps33aQ9D2N9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Vps33aQ9D2N9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Vps33aQ9D2N9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Vps33aQ9D2N9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Vps33aQ9D2N9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Vps33aQ9D2N9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Vps33aQ9D2N9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Vps33aQ9D2N9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Vps33aQ9D2N9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Vps33aQ9D2N9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Vps33aQ9D2N9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Vps33aQ9D2N9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Vps33aQ9D2N9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Vps33aQ9D2N9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,99■■■□□ 2,07
Vps33aQ9D2N9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Vps33aQ9D2N9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Vps33aQ9D2N9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Vps33aQ9D2N9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms