Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ss18l2Q9D174 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ss18l2Q9D174 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ss18l2Q9D174 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ss18l2Q9D174 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ss18l2Q9D174 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ss18l2Q9D174 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ss18l2Q9D174 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ss18l2Q9D174 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ss18l2Q9D174 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ss18l2Q9D174 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ss18l2Q9D174 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ss18l2Q9D174 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ss18l2Q9D174 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ss18l2Q9D174 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ss18l2Q9D174 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ss18l2Q9D174 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ss18l2Q9D174 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ss18l2Q9D174 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ss18l2Q9D174 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ss18l2Q9D174 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ss18l2Q9D174 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ss18l2Q9D174 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ss18l2Q9D174 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ss18l2Q9D174 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ss18l2Q9D174 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ss18l2Q9D174 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ss18l2Q9D174 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ss18l2Q9D174 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ss18l2Q9D174 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ss18l2Q9D174 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ss18l2Q9D174 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ss18l2Q9D174 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ss18l2Q9D174 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ss18l2Q9D174 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ss18l2Q9D174 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ss18l2Q9D174 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ss18l2Q9D174 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ss18l2Q9D174 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ss18l2Q9D174 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ss18l2Q9D174 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ss18l2Q9D174 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ss18l2Q9D174 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ss18l2Q9D174 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ss18l2Q9D174 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ss18l2Q9D174 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ss18l2Q9D174 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ss18l2Q9D174 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ss18l2Q9D174 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ss18l2Q9D174 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ss18l2Q9D174 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ss18l2Q9D174 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ss18l2Q9D174 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ss18l2Q9D174 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ss18l2Q9D174 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ss18l2Q9D174 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ss18l2Q9D174 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ss18l2Q9D174 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ss18l2Q9D174 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ss18l2Q9D174 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ss18l2Q9D174 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ss18l2Q9D174 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ss18l2Q9D174 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ss18l2Q9D174 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ss18l2Q9D174 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ss18l2Q9D174 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ss18l2Q9D174 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ss18l2Q9D174 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ss18l2Q9D174 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ss18l2Q9D174 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ss18l2Q9D174 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ss18l2Q9D174 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ss18l2Q9D174 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ss18l2Q9D174 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ss18l2Q9D174 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ss18l2Q9D174 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ss18l2Q9D174 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ss18l2Q9D174 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ss18l2Q9D174 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ss18l2Q9D174 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ss18l2Q9D174 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ss18l2Q9D174 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ss18l2Q9D174 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ss18l2Q9D174 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ss18l2Q9D174 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ss18l2Q9D174 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ss18l2Q9D174 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ss18l2Q9D174 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ss18l2Q9D174 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ss18l2Q9D174 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ss18l2Q9D174 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ss18l2Q9D174 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ss18l2Q9D174 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ss18l2Q9D174 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ss18l2Q9D174 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ss18l2Q9D174 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ss18l2Q9D174 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ss18l2Q9D174 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ss18l2Q9D174 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ss18l2Q9D174 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms