Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0S4

Neurl2, Neuralized-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl2Q9D0S4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Neurl2Q9D0S4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Neurl2Q9D0S4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Neurl2Q9D0S4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Neurl2Q9D0S4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Neurl2Q9D0S4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Neurl2Q9D0S4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Neurl2Q9D0S4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Neurl2Q9D0S4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Neurl2Q9D0S4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Neurl2Q9D0S4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Neurl2Q9D0S4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Neurl2Q9D0S4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Neurl2Q9D0S4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Neurl2Q9D0S4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurl2Q9D0S4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Neurl2Q9D0S4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Neurl2Q9D0S4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurl2Q9D0S4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Neurl2Q9D0S4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Neurl2Q9D0S4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Neurl2Q9D0S4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Neurl2Q9D0S4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Neurl2Q9D0S4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Neurl2Q9D0S4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Neurl2Q9D0S4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Neurl2Q9D0S4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Neurl2Q9D0S4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Neurl2Q9D0S4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurl2Q9D0S4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Neurl2Q9D0S4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurl2Q9D0S4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurl2Q9D0S4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurl2Q9D0S4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurl2Q9D0S4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurl2Q9D0S4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurl2Q9D0S4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurl2Q9D0S4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurl2Q9D0S4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Neurl2Q9D0S4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurl2Q9D0S4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Neurl2Q9D0S4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Neurl2Q9D0S4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Neurl2Q9D0S4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Neurl2Q9D0S4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurl2Q9D0S4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurl2Q9D0S4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurl2Q9D0S4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Neurl2Q9D0S4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Neurl2Q9D0S4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurl2Q9D0S4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurl2Q9D0S4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Neurl2Q9D0S4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurl2Q9D0S4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurl2Q9D0S4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurl2Q9D0S4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurl2Q9D0S4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurl2Q9D0S4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Neurl2Q9D0S4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Neurl2Q9D0S4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurl2Q9D0S4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurl2Q9D0S4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurl2Q9D0S4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Neurl2Q9D0S4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Neurl2Q9D0S4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurl2Q9D0S4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurl2Q9D0S4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurl2Q9D0S4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurl2Q9D0S4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurl2Q9D0S4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Neurl2Q9D0S4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurl2Q9D0S4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurl2Q9D0S4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurl2Q9D0S4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurl2Q9D0S4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurl2Q9D0S4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurl2Q9D0S4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurl2Q9D0S4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurl2Q9D0S4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurl2Q9D0S4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurl2Q9D0S4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurl2Q9D0S4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurl2Q9D0S4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurl2Q9D0S4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurl2Q9D0S4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurl2Q9D0S4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurl2Q9D0S4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Neurl2Q9D0S4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Neurl2Q9D0S4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Neurl2Q9D0S4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Neurl2Q9D0S4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Neurl2Q9D0S4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Neurl2Q9D0S4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Neurl2Q9D0S4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Neurl2Q9D0S4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurl2Q9D0S4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurl2Q9D0S4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Neurl2Q9D0S4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Neurl2Q9D0S4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Neurl2Q9D0S4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms