Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX7

Pip4p2, Type 2 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p2Q9CZX7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pip4p2Q9CZX7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pip4p2Q9CZX7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pip4p2Q9CZX7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pip4p2Q9CZX7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pip4p2Q9CZX7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pip4p2Q9CZX7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pip4p2Q9CZX7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pip4p2Q9CZX7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pip4p2Q9CZX7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pip4p2Q9CZX7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pip4p2Q9CZX7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pip4p2Q9CZX7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pip4p2Q9CZX7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pip4p2Q9CZX7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pip4p2Q9CZX7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pip4p2Q9CZX7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pip4p2Q9CZX7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pip4p2Q9CZX7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pip4p2Q9CZX7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pip4p2Q9CZX7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pip4p2Q9CZX7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pip4p2Q9CZX7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pip4p2Q9CZX7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pip4p2Q9CZX7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pip4p2Q9CZX7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pip4p2Q9CZX7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pip4p2Q9CZX7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pip4p2Q9CZX7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pip4p2Q9CZX7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pip4p2Q9CZX7 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pip4p2Q9CZX7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pip4p2Q9CZX7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pip4p2Q9CZX7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pip4p2Q9CZX7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pip4p2Q9CZX7 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pip4p2Q9CZX7 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pip4p2Q9CZX7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pip4p2Q9CZX7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pip4p2Q9CZX7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pip4p2Q9CZX7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pip4p2Q9CZX7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pip4p2Q9CZX7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pip4p2Q9CZX7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pip4p2Q9CZX7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pip4p2Q9CZX7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pip4p2Q9CZX7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pip4p2Q9CZX7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pip4p2Q9CZX7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pip4p2Q9CZX7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pip4p2Q9CZX7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pip4p2Q9CZX7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pip4p2Q9CZX7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pip4p2Q9CZX7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pip4p2Q9CZX7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pip4p2Q9CZX7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pip4p2Q9CZX7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pip4p2Q9CZX7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pip4p2Q9CZX7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pip4p2Q9CZX7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pip4p2Q9CZX7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pip4p2Q9CZX7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pip4p2Q9CZX7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pip4p2Q9CZX7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pip4p2Q9CZX7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pip4p2Q9CZX7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pip4p2Q9CZX7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pip4p2Q9CZX7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pip4p2Q9CZX7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pip4p2Q9CZX7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pip4p2Q9CZX7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pip4p2Q9CZX7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pip4p2Q9CZX7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pip4p2Q9CZX7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pip4p2Q9CZX7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pip4p2Q9CZX7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pip4p2Q9CZX7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pip4p2Q9CZX7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pip4p2Q9CZX7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pip4p2Q9CZX7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pip4p2Q9CZX7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pip4p2Q9CZX7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pip4p2Q9CZX7 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pip4p2Q9CZX7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pip4p2Q9CZX7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pip4p2Q9CZX7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pip4p2Q9CZX7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pip4p2Q9CZX7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pip4p2Q9CZX7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pip4p2Q9CZX7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pip4p2Q9CZX7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pip4p2Q9CZX7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pip4p2Q9CZX7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pip4p2Q9CZX7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pip4p2Q9CZX7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pip4p2Q9CZX7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pip4p2Q9CZX7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pip4p2Q9CZX7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pip4p2Q9CZX7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pip4p2Q9CZX7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms