Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZG9

Pdzd11, PDZ domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd11Q9CZG9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21,2■□□□□ 0,98
Pdzd11Q9CZG9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Pdzd11Q9CZG9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Pdzd11Q9CZG9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Pdzd11Q9CZG9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Pdzd11Q9CZG9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Pdzd11Q9CZG9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Pdzd11Q9CZG9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Pdzd11Q9CZG9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21,13■□□□□ 0,97
Pdzd11Q9CZG9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Pdzd11Q9CZG9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Pdzd11Q9CZG9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Pdzd11Q9CZG9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Pdzd11Q9CZG9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21,07■□□□□ 0,96
Pdzd11Q9CZG9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Pdzd11Q9CZG9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Pdzd11Q9CZG9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Pdzd11Q9CZG9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Pdzd11Q9CZG9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Pdzd11Q9CZG9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Pdzd11Q9CZG9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Pdzd11Q9CZG9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Pdzd11Q9CZG9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Pdzd11Q9CZG9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Pdzd11Q9CZG9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Pdzd11Q9CZG9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Pdzd11Q9CZG9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Pdzd11Q9CZG9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Pdzd11Q9CZG9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Pdzd11Q9CZG9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Pdzd11Q9CZG9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Pdzd11Q9CZG9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Pdzd11Q9CZG9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Pdzd11Q9CZG9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Pdzd11Q9CZG9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Pdzd11Q9CZG9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Pdzd11Q9CZG9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20,8■□□□□ 0,92
Pdzd11Q9CZG9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Pdzd11Q9CZG9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Pdzd11Q9CZG9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Pdzd11Q9CZG9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Pdzd11Q9CZG9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Pdzd11Q9CZG9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Pdzd11Q9CZG9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Pdzd11Q9CZG9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Pdzd11Q9CZG9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Pdzd11Q9CZG9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Pdzd11Q9CZG9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Pdzd11Q9CZG9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Pdzd11Q9CZG9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Pdzd11Q9CZG9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Pdzd11Q9CZG9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
Pdzd11Q9CZG9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Pdzd11Q9CZG9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Pdzd11Q9CZG9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Pdzd11Q9CZG9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Pdzd11Q9CZG9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Pdzd11Q9CZG9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
Pdzd11Q9CZG9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
Pdzd11Q9CZG9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20,57■□□□□ 0,88
Pdzd11Q9CZG9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20,56■□□□□ 0,88
Pdzd11Q9CZG9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20,55■□□□□ 0,88
Pdzd11Q9CZG9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20,55■□□□□ 0,88
Pdzd11Q9CZG9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Pdzd11Q9CZG9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Pdzd11Q9CZG9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Pdzd11Q9CZG9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20,52■□□□□ 0,88
Pdzd11Q9CZG9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,52■□□□□ 0,87
Pdzd11Q9CZG9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Pdzd11Q9CZG9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Pdzd11Q9CZG9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,49■□□□□ 0,87
Pdzd11Q9CZG9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Pdzd11Q9CZG9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Pdzd11Q9CZG9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Pdzd11Q9CZG9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Pdzd11Q9CZG9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Pdzd11Q9CZG9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Pdzd11Q9CZG9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Pdzd11Q9CZG9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20,38■□□□□ 0,85
Pdzd11Q9CZG9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Pdzd11Q9CZG9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Pdzd11Q9CZG9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,38■□□□□ 0,85
Pdzd11Q9CZG9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Pdzd11Q9CZG9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Pdzd11Q9CZG9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Pdzd11Q9CZG9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Pdzd11Q9CZG9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Pdzd11Q9CZG9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Pdzd11Q9CZG9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Pdzd11Q9CZG9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Pdzd11Q9CZG9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Pdzd11Q9CZG9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Pdzd11Q9CZG9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20,27■□□□□ 0,84
Pdzd11Q9CZG9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Pdzd11Q9CZG9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Pdzd11Q9CZG9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Pdzd11Q9CZG9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Pdzd11Q9CZG9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,26■□□□□ 0,83
Pdzd11Q9CZG9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,26■□□□□ 0,83
Pdzd11Q9CZG9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,2 ms