Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYT6

Cap2, Adenylyl cyclase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap2Q9CYT6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cap2Q9CYT6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cap2Q9CYT6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Cap2Q9CYT6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Cap2Q9CYT6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cap2Q9CYT6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Cap2Q9CYT6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Cap2Q9CYT6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Cap2Q9CYT6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Cap2Q9CYT6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cap2Q9CYT6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cap2Q9CYT6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Cap2Q9CYT6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cap2Q9CYT6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cap2Q9CYT6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cap2Q9CYT6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cap2Q9CYT6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cap2Q9CYT6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Cap2Q9CYT6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Cap2Q9CYT6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Cap2Q9CYT6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Cap2Q9CYT6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cap2Q9CYT6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cap2Q9CYT6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cap2Q9CYT6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cap2Q9CYT6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cap2Q9CYT6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cap2Q9CYT6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cap2Q9CYT6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cap2Q9CYT6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cap2Q9CYT6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Cap2Q9CYT6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cap2Q9CYT6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cap2Q9CYT6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cap2Q9CYT6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cap2Q9CYT6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cap2Q9CYT6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cap2Q9CYT6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Cap2Q9CYT6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cap2Q9CYT6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cap2Q9CYT6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cap2Q9CYT6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cap2Q9CYT6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Cap2Q9CYT6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Cap2Q9CYT6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Cap2Q9CYT6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cap2Q9CYT6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cap2Q9CYT6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Cap2Q9CYT6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Cap2Q9CYT6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
Cap2Q9CYT6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Cap2Q9CYT6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cap2Q9CYT6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cap2Q9CYT6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cap2Q9CYT6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cap2Q9CYT6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cap2Q9CYT6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cap2Q9CYT6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cap2Q9CYT6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cap2Q9CYT6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Cap2Q9CYT6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Cap2Q9CYT6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cap2Q9CYT6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cap2Q9CYT6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cap2Q9CYT6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cap2Q9CYT6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Cap2Q9CYT6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cap2Q9CYT6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Cap2Q9CYT6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Cap2Q9CYT6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cap2Q9CYT6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cap2Q9CYT6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cap2Q9CYT6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Cap2Q9CYT6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cap2Q9CYT6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Cap2Q9CYT6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cap2Q9CYT6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cap2Q9CYT6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cap2Q9CYT6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cap2Q9CYT6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cap2Q9CYT6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Cap2Q9CYT6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cap2Q9CYT6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cap2Q9CYT6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cap2Q9CYT6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cap2Q9CYT6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cap2Q9CYT6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cap2Q9CYT6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cap2Q9CYT6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cap2Q9CYT6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cap2Q9CYT6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cap2Q9CYT6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cap2Q9CYT6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cap2Q9CYT6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cap2Q9CYT6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cap2Q9CYT6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cap2Q9CYT6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Cap2Q9CYT6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Cap2Q9CYT6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cap2Q9CYT6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms