Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snx2Q9CWK8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snx2Q9CWK8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Snx2Q9CWK8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snx2Q9CWK8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snx2Q9CWK8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snx2Q9CWK8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snx2Q9CWK8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snx2Q9CWK8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx2Q9CWK8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx2Q9CWK8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snx2Q9CWK8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snx2Q9CWK8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snx2Q9CWK8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snx2Q9CWK8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snx2Q9CWK8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snx2Q9CWK8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snx2Q9CWK8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Snx2Q9CWK8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snx2Q9CWK8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snx2Q9CWK8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snx2Q9CWK8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snx2Q9CWK8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snx2Q9CWK8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snx2Q9CWK8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Snx2Q9CWK8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Snx2Q9CWK8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snx2Q9CWK8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Snx2Q9CWK8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx2Q9CWK8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snx2Q9CWK8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snx2Q9CWK8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx2Q9CWK8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx2Q9CWK8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Snx2Q9CWK8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snx2Q9CWK8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snx2Q9CWK8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snx2Q9CWK8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snx2Q9CWK8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snx2Q9CWK8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snx2Q9CWK8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx2Q9CWK8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx2Q9CWK8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx2Q9CWK8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snx2Q9CWK8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Snx2Q9CWK8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snx2Q9CWK8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Snx2Q9CWK8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snx2Q9CWK8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx2Q9CWK8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx2Q9CWK8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx2Q9CWK8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snx2Q9CWK8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Snx2Q9CWK8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snx2Q9CWK8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snx2Q9CWK8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snx2Q9CWK8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Snx2Q9CWK8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snx2Q9CWK8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snx2Q9CWK8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snx2Q9CWK8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snx2Q9CWK8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snx2Q9CWK8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx2Q9CWK8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx2Q9CWK8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snx2Q9CWK8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snx2Q9CWK8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Snx2Q9CWK8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Snx2Q9CWK8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snx2Q9CWK8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snx2Q9CWK8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snx2Q9CWK8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snx2Q9CWK8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snx2Q9CWK8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snx2Q9CWK8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snx2Q9CWK8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snx2Q9CWK8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snx2Q9CWK8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snx2Q9CWK8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snx2Q9CWK8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snx2Q9CWK8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snx2Q9CWK8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snx2Q9CWK8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snx2Q9CWK8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx2Q9CWK8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx2Q9CWK8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx2Q9CWK8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx2Q9CWK8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx2Q9CWK8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx2Q9CWK8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx2Q9CWK8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx2Q9CWK8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx2Q9CWK8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx2Q9CWK8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snx2Q9CWK8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snx2Q9CWK8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Snx2Q9CWK8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx2Q9CWK8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx2Q9CWK8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx2Q9CWK8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms