Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smurf1Q9CUN6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smurf1Q9CUN6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smurf1Q9CUN6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smurf1Q9CUN6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smurf1Q9CUN6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smurf1Q9CUN6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smurf1Q9CUN6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smurf1Q9CUN6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smurf1Q9CUN6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smurf1Q9CUN6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smurf1Q9CUN6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smurf1Q9CUN6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smurf1Q9CUN6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smurf1Q9CUN6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Smurf1Q9CUN6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smurf1Q9CUN6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smurf1Q9CUN6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smurf1Q9CUN6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smurf1Q9CUN6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smurf1Q9CUN6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smurf1Q9CUN6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smurf1Q9CUN6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smurf1Q9CUN6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smurf1Q9CUN6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smurf1Q9CUN6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smurf1Q9CUN6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smurf1Q9CUN6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smurf1Q9CUN6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smurf1Q9CUN6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Smurf1Q9CUN6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smurf1Q9CUN6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Smurf1Q9CUN6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smurf1Q9CUN6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smurf1Q9CUN6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smurf1Q9CUN6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smurf1Q9CUN6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smurf1Q9CUN6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smurf1Q9CUN6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smurf1Q9CUN6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smurf1Q9CUN6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smurf1Q9CUN6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smurf1Q9CUN6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Smurf1Q9CUN6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smurf1Q9CUN6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smurf1Q9CUN6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smurf1Q9CUN6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Smurf1Q9CUN6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smurf1Q9CUN6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smurf1Q9CUN6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smurf1Q9CUN6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smurf1Q9CUN6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smurf1Q9CUN6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smurf1Q9CUN6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smurf1Q9CUN6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smurf1Q9CUN6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smurf1Q9CUN6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smurf1Q9CUN6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smurf1Q9CUN6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smurf1Q9CUN6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smurf1Q9CUN6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smurf1Q9CUN6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smurf1Q9CUN6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smurf1Q9CUN6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smurf1Q9CUN6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Smurf1Q9CUN6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smurf1Q9CUN6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smurf1Q9CUN6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smurf1Q9CUN6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smurf1Q9CUN6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smurf1Q9CUN6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smurf1Q9CUN6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smurf1Q9CUN6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smurf1Q9CUN6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smurf1Q9CUN6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smurf1Q9CUN6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Smurf1Q9CUN6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smurf1Q9CUN6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smurf1Q9CUN6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smurf1Q9CUN6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smurf1Q9CUN6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smurf1Q9CUN6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smurf1Q9CUN6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smurf1Q9CUN6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smurf1Q9CUN6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smurf1Q9CUN6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smurf1Q9CUN6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smurf1Q9CUN6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smurf1Q9CUN6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smurf1Q9CUN6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smurf1Q9CUN6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smurf1Q9CUN6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smurf1Q9CUN6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smurf1Q9CUN6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smurf1Q9CUN6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smurf1Q9CUN6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smurf1Q9CUN6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smurf1Q9CUN6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smurf1Q9CUN6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms