Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS74

Ecd, Protein ecdysoneless homolog, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EcdQ9CS74 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EcdQ9CS74 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EcdQ9CS74 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EcdQ9CS74 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EcdQ9CS74 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EcdQ9CS74 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EcdQ9CS74 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EcdQ9CS74 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EcdQ9CS74 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EcdQ9CS74 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EcdQ9CS74 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EcdQ9CS74 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EcdQ9CS74 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EcdQ9CS74 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EcdQ9CS74 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EcdQ9CS74 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EcdQ9CS74 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EcdQ9CS74 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EcdQ9CS74 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EcdQ9CS74 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EcdQ9CS74 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EcdQ9CS74 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EcdQ9CS74 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EcdQ9CS74 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EcdQ9CS74 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EcdQ9CS74 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EcdQ9CS74 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EcdQ9CS74 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EcdQ9CS74 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EcdQ9CS74 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EcdQ9CS74 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EcdQ9CS74 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EcdQ9CS74 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EcdQ9CS74 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EcdQ9CS74 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EcdQ9CS74 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EcdQ9CS74 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EcdQ9CS74 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EcdQ9CS74 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EcdQ9CS74 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EcdQ9CS74 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EcdQ9CS74 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EcdQ9CS74 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EcdQ9CS74 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EcdQ9CS74 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EcdQ9CS74 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EcdQ9CS74 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EcdQ9CS74 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EcdQ9CS74 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EcdQ9CS74 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EcdQ9CS74 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EcdQ9CS74 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EcdQ9CS74 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EcdQ9CS74 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EcdQ9CS74 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EcdQ9CS74 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EcdQ9CS74 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EcdQ9CS74 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EcdQ9CS74 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EcdQ9CS74 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EcdQ9CS74 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EcdQ9CS74 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EcdQ9CS74 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EcdQ9CS74 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EcdQ9CS74 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EcdQ9CS74 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EcdQ9CS74 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EcdQ9CS74 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EcdQ9CS74 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EcdQ9CS74 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EcdQ9CS74 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EcdQ9CS74 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EcdQ9CS74 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EcdQ9CS74 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EcdQ9CS74 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EcdQ9CS74 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EcdQ9CS74 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EcdQ9CS74 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EcdQ9CS74 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EcdQ9CS74 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EcdQ9CS74 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EcdQ9CS74 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EcdQ9CS74 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EcdQ9CS74 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EcdQ9CS74 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EcdQ9CS74 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EcdQ9CS74 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EcdQ9CS74 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EcdQ9CS74 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EcdQ9CS74 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EcdQ9CS74 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EcdQ9CS74 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EcdQ9CS74 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EcdQ9CS74 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EcdQ9CS74 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EcdQ9CS74 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EcdQ9CS74 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EcdQ9CS74 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EcdQ9CS74 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EcdQ9CS74 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms