Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX6

Gm16286, MCG141091, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16286Q9CQX6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Gm16286Q9CQX6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Gm16286Q9CQX6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Gm16286Q9CQX6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Gm16286Q9CQX6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Gm16286Q9CQX6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Gm16286Q9CQX6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Gm16286Q9CQX6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Gm16286Q9CQX6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Gm16286Q9CQX6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Gm16286Q9CQX6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,84
Gm16286Q9CQX6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Gm16286Q9CQX6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Gm16286Q9CQX6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Gm16286Q9CQX6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,41■■□□□ 1,82
Gm16286Q9CQX6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Gm16286Q9CQX6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Gm16286Q9CQX6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Gm16286Q9CQX6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Gm16286Q9CQX6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Gm16286Q9CQX6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Gm16286Q9CQX6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Gm16286Q9CQX6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Gm16286Q9CQX6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Gm16286Q9CQX6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Gm16286Q9CQX6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Gm16286Q9CQX6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Gm16286Q9CQX6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,26■■□□□ 1,79
Gm16286Q9CQX6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Gm16286Q9CQX6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Gm16286Q9CQX6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Gm16286Q9CQX6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Gm16286Q9CQX6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Gm16286Q9CQX6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Gm16286Q9CQX6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,79
Gm16286Q9CQX6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Gm16286Q9CQX6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,17■■□□□ 1,78
Gm16286Q9CQX6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Gm16286Q9CQX6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Gm16286Q9CQX6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Gm16286Q9CQX6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Gm16286Q9CQX6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Gm16286Q9CQX6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Gm16286Q9CQX6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Gm16286Q9CQX6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Gm16286Q9CQX6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Gm16286Q9CQX6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25,9■■□□□ 1,74
Gm16286Q9CQX6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Gm16286Q9CQX6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Gm16286Q9CQX6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Gm16286Q9CQX6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Gm16286Q9CQX6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Gm16286Q9CQX6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Gm16286Q9CQX6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Gm16286Q9CQX6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Gm16286Q9CQX6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Gm16286Q9CQX6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Gm16286Q9CQX6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Gm16286Q9CQX6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Gm16286Q9CQX6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Gm16286Q9CQX6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,76■■□□□ 1,71
Gm16286Q9CQX6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Gm16286Q9CQX6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Gm16286Q9CQX6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Gm16286Q9CQX6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Gm16286Q9CQX6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Gm16286Q9CQX6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Gm16286Q9CQX6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Gm16286Q9CQX6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Gm16286Q9CQX6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Gm16286Q9CQX6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
Gm16286Q9CQX6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Gm16286Q9CQX6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Gm16286Q9CQX6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Gm16286Q9CQX6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
Gm16286Q9CQX6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Gm16286Q9CQX6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Gm16286Q9CQX6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Gm16286Q9CQX6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Gm16286Q9CQX6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Gm16286Q9CQX6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Gm16286Q9CQX6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,54■■□□□ 1,68
Gm16286Q9CQX6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gm16286Q9CQX6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Gm16286Q9CQX6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Gm16286Q9CQX6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Gm16286Q9CQX6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Gm16286Q9CQX6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Gm16286Q9CQX6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Gm16286Q9CQX6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Gm16286Q9CQX6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Gm16286Q9CQX6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Gm16286Q9CQX6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Gm16286Q9CQX6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Gm16286Q9CQX6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Gm16286Q9CQX6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gm16286Q9CQX6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gm16286Q9CQX6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Gm16286Q9CQX6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
Gm16286Q9CQX6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,37■■□□□ 1,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms