Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PsenenQ9CQR7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PsenenQ9CQR7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PsenenQ9CQR7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PsenenQ9CQR7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PsenenQ9CQR7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PsenenQ9CQR7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PsenenQ9CQR7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PsenenQ9CQR7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PsenenQ9CQR7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PsenenQ9CQR7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PsenenQ9CQR7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PsenenQ9CQR7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PsenenQ9CQR7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PsenenQ9CQR7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PsenenQ9CQR7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PsenenQ9CQR7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PsenenQ9CQR7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PsenenQ9CQR7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PsenenQ9CQR7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PsenenQ9CQR7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PsenenQ9CQR7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PsenenQ9CQR7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PsenenQ9CQR7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PsenenQ9CQR7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PsenenQ9CQR7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PsenenQ9CQR7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PsenenQ9CQR7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PsenenQ9CQR7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PsenenQ9CQR7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PsenenQ9CQR7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PsenenQ9CQR7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PsenenQ9CQR7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PsenenQ9CQR7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PsenenQ9CQR7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PsenenQ9CQR7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PsenenQ9CQR7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PsenenQ9CQR7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PsenenQ9CQR7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PsenenQ9CQR7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PsenenQ9CQR7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PsenenQ9CQR7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PsenenQ9CQR7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PsenenQ9CQR7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PsenenQ9CQR7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PsenenQ9CQR7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PsenenQ9CQR7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PsenenQ9CQR7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PsenenQ9CQR7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PsenenQ9CQR7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PsenenQ9CQR7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PsenenQ9CQR7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PsenenQ9CQR7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PsenenQ9CQR7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PsenenQ9CQR7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PsenenQ9CQR7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PsenenQ9CQR7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PsenenQ9CQR7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PsenenQ9CQR7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PsenenQ9CQR7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PsenenQ9CQR7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PsenenQ9CQR7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PsenenQ9CQR7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PsenenQ9CQR7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PsenenQ9CQR7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PsenenQ9CQR7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PsenenQ9CQR7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PsenenQ9CQR7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PsenenQ9CQR7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PsenenQ9CQR7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PsenenQ9CQR7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PsenenQ9CQR7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PsenenQ9CQR7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PsenenQ9CQR7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PsenenQ9CQR7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PsenenQ9CQR7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PsenenQ9CQR7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PsenenQ9CQR7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PsenenQ9CQR7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PsenenQ9CQR7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PsenenQ9CQR7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PsenenQ9CQR7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PsenenQ9CQR7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PsenenQ9CQR7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PsenenQ9CQR7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PsenenQ9CQR7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PsenenQ9CQR7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PsenenQ9CQR7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PsenenQ9CQR7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PsenenQ9CQR7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PsenenQ9CQR7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PsenenQ9CQR7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PsenenQ9CQR7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PsenenQ9CQR7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PsenenQ9CQR7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PsenenQ9CQR7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PsenenQ9CQR7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PsenenQ9CQR7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PsenenQ9CQR7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PsenenQ9CQR7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms