Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp5f1Q9CQQ7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp5f1Q9CQQ7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp5f1Q9CQQ7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp5f1Q9CQQ7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp5f1Q9CQQ7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp5f1Q9CQQ7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp5f1Q9CQQ7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp5f1Q9CQQ7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp5f1Q9CQQ7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp5f1Q9CQQ7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp5f1Q9CQQ7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp5f1Q9CQQ7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp5f1Q9CQQ7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp5f1Q9CQQ7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp5f1Q9CQQ7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp5f1Q9CQQ7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp5f1Q9CQQ7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp5f1Q9CQQ7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp5f1Q9CQQ7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp5f1Q9CQQ7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp5f1Q9CQQ7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp5f1Q9CQQ7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp5f1Q9CQQ7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp5f1Q9CQQ7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp5f1Q9CQQ7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp5f1Q9CQQ7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp5f1Q9CQQ7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp5f1Q9CQQ7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp5f1Q9CQQ7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp5f1Q9CQQ7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp5f1Q9CQQ7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp5f1Q9CQQ7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp5f1Q9CQQ7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp5f1Q9CQQ7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp5f1Q9CQQ7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp5f1Q9CQQ7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp5f1Q9CQQ7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp5f1Q9CQQ7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp5f1Q9CQQ7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp5f1Q9CQQ7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp5f1Q9CQQ7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp5f1Q9CQQ7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp5f1Q9CQQ7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp5f1Q9CQQ7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp5f1Q9CQQ7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp5f1Q9CQQ7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp5f1Q9CQQ7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp5f1Q9CQQ7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp5f1Q9CQQ7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp5f1Q9CQQ7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp5f1Q9CQQ7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp5f1Q9CQQ7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp5f1Q9CQQ7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp5f1Q9CQQ7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp5f1Q9CQQ7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp5f1Q9CQQ7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp5f1Q9CQQ7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp5f1Q9CQQ7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp5f1Q9CQQ7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp5f1Q9CQQ7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp5f1Q9CQQ7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp5f1Q9CQQ7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp5f1Q9CQQ7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp5f1Q9CQQ7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp5f1Q9CQQ7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp5f1Q9CQQ7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp5f1Q9CQQ7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp5f1Q9CQQ7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp5f1Q9CQQ7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp5f1Q9CQQ7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp5f1Q9CQQ7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp5f1Q9CQQ7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp5f1Q9CQQ7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp5f1Q9CQQ7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp5f1Q9CQQ7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp5f1Q9CQQ7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp5f1Q9CQQ7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp5f1Q9CQQ7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp5f1Q9CQQ7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp5f1Q9CQQ7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp5f1Q9CQQ7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp5f1Q9CQQ7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp5f1Q9CQQ7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp5f1Q9CQQ7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp5f1Q9CQQ7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp5f1Q9CQQ7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp5f1Q9CQQ7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms