Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
StambpQ9CQ26 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
StambpQ9CQ26 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
StambpQ9CQ26 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
StambpQ9CQ26 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
StambpQ9CQ26 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
StambpQ9CQ26 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
StambpQ9CQ26 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
StambpQ9CQ26 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
StambpQ9CQ26 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,62■■■□□ 2,01
StambpQ9CQ26 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,6■■■□□ 2,01
StambpQ9CQ26 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,59■■■□□ 2,01
StambpQ9CQ26 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,59■■■□□ 2,01
StambpQ9CQ26 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
StambpQ9CQ26 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
StambpQ9CQ26 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
StambpQ9CQ26 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
StambpQ9CQ26 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
StambpQ9CQ26 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
StambpQ9CQ26 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
StambpQ9CQ26 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,39■■□□□ 1,98
StambpQ9CQ26 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
StambpQ9CQ26 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
StambpQ9CQ26 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
StambpQ9CQ26 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
StambpQ9CQ26 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
StambpQ9CQ26 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
StambpQ9CQ26 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,32■■□□□ 1,96
StambpQ9CQ26 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,27■■□□□ 1,96
StambpQ9CQ26 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
StambpQ9CQ26 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
StambpQ9CQ26 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
StambpQ9CQ26 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
StambpQ9CQ26 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,16■■□□□ 1,94
StambpQ9CQ26 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,16■■□□□ 1,94
StambpQ9CQ26 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,16■■□□□ 1,94
StambpQ9CQ26 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
StambpQ9CQ26 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
StambpQ9CQ26 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
StambpQ9CQ26 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
StambpQ9CQ26 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
StambpQ9CQ26 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
StambpQ9CQ26 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
StambpQ9CQ26 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
StambpQ9CQ26 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
StambpQ9CQ26 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,05■■□□□ 1,92
StambpQ9CQ26 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
StambpQ9CQ26 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
StambpQ9CQ26 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
StambpQ9CQ26 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
StambpQ9CQ26 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,92
StambpQ9CQ26 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
StambpQ9CQ26 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
StambpQ9CQ26 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
StambpQ9CQ26 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
StambpQ9CQ26 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
StambpQ9CQ26 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
StambpQ9CQ26 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
StambpQ9CQ26 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
StambpQ9CQ26 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,84■■□□□ 1,89
StambpQ9CQ26 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
StambpQ9CQ26 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,84■■□□□ 1,89
StambpQ9CQ26 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
StambpQ9CQ26 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
StambpQ9CQ26 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
StambpQ9CQ26 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,78■■□□□ 1,88
StambpQ9CQ26 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
StambpQ9CQ26 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
StambpQ9CQ26 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
StambpQ9CQ26 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
StambpQ9CQ26 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,75■■□□□ 1,87
StambpQ9CQ26 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26,74■■□□□ 1,87
StambpQ9CQ26 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
StambpQ9CQ26 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,72■■□□□ 1,87
StambpQ9CQ26 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
StambpQ9CQ26 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
StambpQ9CQ26 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,71■■□□□ 1,87
StambpQ9CQ26 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
StambpQ9CQ26 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,68■■□□□ 1,86
StambpQ9CQ26 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26,67■■□□□ 1,86
StambpQ9CQ26 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26,67■■□□□ 1,86
StambpQ9CQ26 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
StambpQ9CQ26 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,63■■□□□ 1,85
StambpQ9CQ26 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
StambpQ9CQ26 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
StambpQ9CQ26 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
StambpQ9CQ26 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
StambpQ9CQ26 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,54■■□□□ 1,84
StambpQ9CQ26 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
StambpQ9CQ26 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
StambpQ9CQ26 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,52■■□□□ 1,84
StambpQ9CQ26 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
StambpQ9CQ26 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
StambpQ9CQ26 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
StambpQ9CQ26 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
StambpQ9CQ26 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,46■■□□□ 1,83
StambpQ9CQ26 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
StambpQ9CQ26 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,45■■□□□ 1,82
StambpQ9CQ26 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
StambpQ9CQ26 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms