Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc198Q9CPZ1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc198Q9CPZ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc198Q9CPZ1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc198Q9CPZ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc198Q9CPZ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc198Q9CPZ1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc198Q9CPZ1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc198Q9CPZ1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc198Q9CPZ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc198Q9CPZ1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc198Q9CPZ1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc198Q9CPZ1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc198Q9CPZ1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc198Q9CPZ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc198Q9CPZ1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc198Q9CPZ1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc198Q9CPZ1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc198Q9CPZ1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc198Q9CPZ1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc198Q9CPZ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc198Q9CPZ1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc198Q9CPZ1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc198Q9CPZ1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc198Q9CPZ1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc198Q9CPZ1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc198Q9CPZ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc198Q9CPZ1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc198Q9CPZ1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc198Q9CPZ1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc198Q9CPZ1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc198Q9CPZ1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc198Q9CPZ1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc198Q9CPZ1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc198Q9CPZ1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc198Q9CPZ1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc198Q9CPZ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc198Q9CPZ1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc198Q9CPZ1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc198Q9CPZ1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc198Q9CPZ1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc198Q9CPZ1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc198Q9CPZ1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc198Q9CPZ1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc198Q9CPZ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc198Q9CPZ1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc198Q9CPZ1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc198Q9CPZ1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc198Q9CPZ1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc198Q9CPZ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc198Q9CPZ1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc198Q9CPZ1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc198Q9CPZ1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc198Q9CPZ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc198Q9CPZ1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc198Q9CPZ1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc198Q9CPZ1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc198Q9CPZ1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc198Q9CPZ1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc198Q9CPZ1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc198Q9CPZ1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc198Q9CPZ1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc198Q9CPZ1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc198Q9CPZ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc198Q9CPZ1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc198Q9CPZ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc198Q9CPZ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc198Q9CPZ1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc198Q9CPZ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc198Q9CPZ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc198Q9CPZ1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc198Q9CPZ1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc198Q9CPZ1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc198Q9CPZ1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc198Q9CPZ1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc198Q9CPZ1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc198Q9CPZ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc198Q9CPZ1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc198Q9CPZ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc198Q9CPZ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc198Q9CPZ1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc198Q9CPZ1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc198Q9CPZ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc198Q9CPZ1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc198Q9CPZ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc198Q9CPZ1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc198Q9CPZ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc198Q9CPZ1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc198Q9CPZ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc198Q9CPZ1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc198Q9CPZ1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc198Q9CPZ1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc198Q9CPZ1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms