Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ska1Q9CPV1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ska1Q9CPV1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ska1Q9CPV1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ska1Q9CPV1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ska1Q9CPV1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ska1Q9CPV1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ska1Q9CPV1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ska1Q9CPV1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ska1Q9CPV1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ska1Q9CPV1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ska1Q9CPV1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ska1Q9CPV1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ska1Q9CPV1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ska1Q9CPV1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ska1Q9CPV1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ska1Q9CPV1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ska1Q9CPV1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ska1Q9CPV1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ska1Q9CPV1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ska1Q9CPV1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ska1Q9CPV1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ska1Q9CPV1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ska1Q9CPV1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ska1Q9CPV1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ska1Q9CPV1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ska1Q9CPV1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ska1Q9CPV1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ska1Q9CPV1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ska1Q9CPV1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ska1Q9CPV1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ska1Q9CPV1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ska1Q9CPV1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ska1Q9CPV1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ska1Q9CPV1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ska1Q9CPV1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ska1Q9CPV1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ska1Q9CPV1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ska1Q9CPV1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ska1Q9CPV1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ska1Q9CPV1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ska1Q9CPV1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ska1Q9CPV1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ska1Q9CPV1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ska1Q9CPV1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ska1Q9CPV1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ska1Q9CPV1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ska1Q9CPV1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ska1Q9CPV1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ska1Q9CPV1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ska1Q9CPV1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ska1Q9CPV1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ska1Q9CPV1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ska1Q9CPV1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ska1Q9CPV1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ska1Q9CPV1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ska1Q9CPV1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ska1Q9CPV1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ska1Q9CPV1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ska1Q9CPV1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ska1Q9CPV1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ska1Q9CPV1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ska1Q9CPV1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ska1Q9CPV1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ska1Q9CPV1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ska1Q9CPV1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ska1Q9CPV1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ska1Q9CPV1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ska1Q9CPV1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ska1Q9CPV1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ska1Q9CPV1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ska1Q9CPV1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ska1Q9CPV1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ska1Q9CPV1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ska1Q9CPV1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ska1Q9CPV1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ska1Q9CPV1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ska1Q9CPV1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ska1Q9CPV1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ska1Q9CPV1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ska1Q9CPV1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ska1Q9CPV1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ska1Q9CPV1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ska1Q9CPV1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ska1Q9CPV1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ska1Q9CPV1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ska1Q9CPV1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ska1Q9CPV1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ska1Q9CPV1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ska1Q9CPV1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ska1Q9CPV1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ska1Q9CPV1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ska1Q9CPV1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ska1Q9CPV1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ska1Q9CPV1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ska1Q9CPV1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ska1Q9CPV1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ska1Q9CPV1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ska1Q9CPV1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ska1Q9CPV1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms