Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Nsmce3Q9CPR8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Nsmce3Q9CPR8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Nsmce3Q9CPR8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Nsmce3Q9CPR8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Nsmce3Q9CPR8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Nsmce3Q9CPR8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Nsmce3Q9CPR8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Nsmce3Q9CPR8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Nsmce3Q9CPR8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Nsmce3Q9CPR8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,95■■□□□ 1,9
Nsmce3Q9CPR8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Nsmce3Q9CPR8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Nsmce3Q9CPR8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Nsmce3Q9CPR8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Nsmce3Q9CPR8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Nsmce3Q9CPR8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Nsmce3Q9CPR8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,82■■□□□ 1,88
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Nsmce3Q9CPR8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Nsmce3Q9CPR8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Nsmce3Q9CPR8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Nsmce3Q9CPR8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Nsmce3Q9CPR8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Nsmce3Q9CPR8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Nsmce3Q9CPR8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Nsmce3Q9CPR8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Nsmce3Q9CPR8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Nsmce3Q9CPR8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Nsmce3Q9CPR8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Nsmce3Q9CPR8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,57■■□□□ 1,84
Nsmce3Q9CPR8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Nsmce3Q9CPR8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26,55■■□□□ 1,84
Nsmce3Q9CPR8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Nsmce3Q9CPR8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Nsmce3Q9CPR8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Nsmce3Q9CPR8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Nsmce3Q9CPR8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Nsmce3Q9CPR8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Nsmce3Q9CPR8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,46■■□□□ 1,83
Nsmce3Q9CPR8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Nsmce3Q9CPR8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,45■■□□□ 1,82
Nsmce3Q9CPR8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Nsmce3Q9CPR8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Nsmce3Q9CPR8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Nsmce3Q9CPR8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Nsmce3Q9CPR8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Nsmce3Q9CPR8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Nsmce3Q9CPR8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Nsmce3Q9CPR8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Nsmce3Q9CPR8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26,33■■□□□ 1,81
Nsmce3Q9CPR8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,8
Nsmce3Q9CPR8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Nsmce3Q9CPR8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Nsmce3Q9CPR8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Nsmce3Q9CPR8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Nsmce3Q9CPR8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Nsmce3Q9CPR8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Nsmce3Q9CPR8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Nsmce3Q9CPR8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Nsmce3Q9CPR8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Nsmce3Q9CPR8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,79
Nsmce3Q9CPR8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Nsmce3Q9CPR8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Nsmce3Q9CPR8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Nsmce3Q9CPR8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Nsmce3Q9CPR8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Nsmce3Q9CPR8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Nsmce3Q9CPR8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Nsmce3Q9CPR8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Nsmce3Q9CPR8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Nsmce3Q9CPR8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Nsmce3Q9CPR8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26,04■■□□□ 1,76
Nsmce3Q9CPR8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Nsmce3Q9CPR8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Nsmce3Q9CPR8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Nsmce3Q9CPR8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Nsmce3Q9CPR8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26■■□□□ 1,75
Nsmce3Q9CPR8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Nsmce3Q9CPR8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Nsmce3Q9CPR8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Nsmce3Q9CPR8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Nsmce3Q9CPR8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Nsmce3Q9CPR8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Nsmce3Q9CPR8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Nsmce3Q9CPR8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Nsmce3Q9CPR8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Nsmce3Q9CPR8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Nsmce3Q9CPR8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Nsmce3Q9CPR8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Nsmce3Q9CPR8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Nsmce3Q9CPR8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Nsmce3Q9CPR8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Nsmce3Q9CPR8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Nsmce3Q9CPR8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Nsmce3Q9CPR8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Nsmce3Q9CPR8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Nsmce3Q9CPR8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Nsmce3Q9CPR8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,81■■□□□ 1,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,2 ms