Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Bcl11bQ99PV8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Bcl11bQ99PV8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Bcl11bQ99PV8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Bcl11bQ99PV8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Bcl11bQ99PV8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Bcl11bQ99PV8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Bcl11bQ99PV8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Bcl11bQ99PV8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Bcl11bQ99PV8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Bcl11bQ99PV8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Bcl11bQ99PV8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Bcl11bQ99PV8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Bcl11bQ99PV8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Bcl11bQ99PV8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Bcl11bQ99PV8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Bcl11bQ99PV8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Bcl11bQ99PV8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Bcl11bQ99PV8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Bcl11bQ99PV8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Bcl11bQ99PV8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Bcl11bQ99PV8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Bcl11bQ99PV8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Bcl11bQ99PV8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Bcl11bQ99PV8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Bcl11bQ99PV8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Bcl11bQ99PV8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
Bcl11bQ99PV8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Bcl11bQ99PV8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Bcl11bQ99PV8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Bcl11bQ99PV8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
Bcl11bQ99PV8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Bcl11bQ99PV8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Bcl11bQ99PV8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Bcl11bQ99PV8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Bcl11bQ99PV8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Bcl11bQ99PV8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Bcl11bQ99PV8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
Bcl11bQ99PV8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
Bcl11bQ99PV8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Bcl11bQ99PV8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Bcl11bQ99PV8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Bcl11bQ99PV8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Bcl11bQ99PV8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Bcl11bQ99PV8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Bcl11bQ99PV8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
Bcl11bQ99PV8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Bcl11bQ99PV8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
Bcl11bQ99PV8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Bcl11bQ99PV8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Bcl11bQ99PV8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Bcl11bQ99PV8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Bcl11bQ99PV8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Bcl11bQ99PV8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Bcl11bQ99PV8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Bcl11bQ99PV8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Bcl11bQ99PV8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Bcl11bQ99PV8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Bcl11bQ99PV8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Bcl11bQ99PV8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Bcl11bQ99PV8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Bcl11bQ99PV8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Bcl11bQ99PV8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Bcl11bQ99PV8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Bcl11bQ99PV8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Bcl11bQ99PV8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Bcl11bQ99PV8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Bcl11bQ99PV8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Bcl11bQ99PV8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Bcl11bQ99PV8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Bcl11bQ99PV8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
Bcl11bQ99PV8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Bcl11bQ99PV8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Bcl11bQ99PV8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Bcl11bQ99PV8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Bcl11bQ99PV8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Bcl11bQ99PV8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Bcl11bQ99PV8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Bcl11bQ99PV8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Bcl11bQ99PV8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Bcl11bQ99PV8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Bcl11bQ99PV8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Bcl11bQ99PV8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Bcl11bQ99PV8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Bcl11bQ99PV8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Bcl11bQ99PV8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Bcl11bQ99PV8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Bcl11bQ99PV8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Bcl11bQ99PV8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Bcl11bQ99PV8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Bcl11bQ99PV8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Bcl11bQ99PV8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Bcl11bQ99PV8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Bcl11bQ99PV8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Bcl11bQ99PV8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Bcl11bQ99PV8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
Bcl11bQ99PV8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Bcl11bQ99PV8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Bcl11bQ99PV8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Bcl11bQ99PV8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms