Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trim12aQ99PQ1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Trim12aQ99PQ1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim12aQ99PQ1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim12aQ99PQ1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim12aQ99PQ1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim12aQ99PQ1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim12aQ99PQ1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trim12aQ99PQ1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim12aQ99PQ1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim12aQ99PQ1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim12aQ99PQ1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim12aQ99PQ1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim12aQ99PQ1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim12aQ99PQ1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim12aQ99PQ1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim12aQ99PQ1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim12aQ99PQ1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim12aQ99PQ1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim12aQ99PQ1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim12aQ99PQ1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim12aQ99PQ1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim12aQ99PQ1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim12aQ99PQ1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim12aQ99PQ1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim12aQ99PQ1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim12aQ99PQ1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim12aQ99PQ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim12aQ99PQ1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim12aQ99PQ1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim12aQ99PQ1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim12aQ99PQ1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim12aQ99PQ1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim12aQ99PQ1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim12aQ99PQ1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim12aQ99PQ1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim12aQ99PQ1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim12aQ99PQ1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim12aQ99PQ1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim12aQ99PQ1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim12aQ99PQ1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim12aQ99PQ1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim12aQ99PQ1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim12aQ99PQ1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim12aQ99PQ1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim12aQ99PQ1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim12aQ99PQ1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim12aQ99PQ1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim12aQ99PQ1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim12aQ99PQ1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim12aQ99PQ1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim12aQ99PQ1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim12aQ99PQ1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim12aQ99PQ1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim12aQ99PQ1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim12aQ99PQ1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim12aQ99PQ1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim12aQ99PQ1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim12aQ99PQ1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim12aQ99PQ1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim12aQ99PQ1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim12aQ99PQ1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim12aQ99PQ1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim12aQ99PQ1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim12aQ99PQ1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim12aQ99PQ1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim12aQ99PQ1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim12aQ99PQ1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim12aQ99PQ1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim12aQ99PQ1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim12aQ99PQ1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim12aQ99PQ1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim12aQ99PQ1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim12aQ99PQ1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim12aQ99PQ1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim12aQ99PQ1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim12aQ99PQ1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim12aQ99PQ1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim12aQ99PQ1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim12aQ99PQ1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim12aQ99PQ1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim12aQ99PQ1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim12aQ99PQ1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trim12aQ99PQ1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim12aQ99PQ1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim12aQ99PQ1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim12aQ99PQ1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim12aQ99PQ1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim12aQ99PQ1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trim12aQ99PQ1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim12aQ99PQ1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim12aQ99PQ1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim12aQ99PQ1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim12aQ99PQ1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim12aQ99PQ1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim12aQ99PQ1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim12aQ99PQ1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim12aQ99PQ1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim12aQ99PQ1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim12aQ99PQ1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
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