Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubxn6Q99PL6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ubxn6Q99PL6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ubxn6Q99PL6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ubxn6Q99PL6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ubxn6Q99PL6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ubxn6Q99PL6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubxn6Q99PL6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ubxn6Q99PL6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ubxn6Q99PL6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ubxn6Q99PL6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ubxn6Q99PL6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ubxn6Q99PL6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ubxn6Q99PL6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ubxn6Q99PL6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ubxn6Q99PL6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubxn6Q99PL6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ubxn6Q99PL6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ubxn6Q99PL6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ubxn6Q99PL6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ubxn6Q99PL6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ubxn6Q99PL6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ubxn6Q99PL6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ubxn6Q99PL6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ubxn6Q99PL6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ubxn6Q99PL6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ubxn6Q99PL6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ubxn6Q99PL6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ubxn6Q99PL6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubxn6Q99PL6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubxn6Q99PL6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubxn6Q99PL6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubxn6Q99PL6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubxn6Q99PL6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubxn6Q99PL6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubxn6Q99PL6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubxn6Q99PL6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubxn6Q99PL6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ubxn6Q99PL6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ubxn6Q99PL6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ubxn6Q99PL6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubxn6Q99PL6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ubxn6Q99PL6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ubxn6Q99PL6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ubxn6Q99PL6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ubxn6Q99PL6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ubxn6Q99PL6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ubxn6Q99PL6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubxn6Q99PL6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubxn6Q99PL6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ubxn6Q99PL6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ubxn6Q99PL6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ubxn6Q99PL6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ubxn6Q99PL6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ubxn6Q99PL6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ubxn6Q99PL6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ubxn6Q99PL6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ubxn6Q99PL6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ubxn6Q99PL6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ubxn6Q99PL6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ubxn6Q99PL6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ubxn6Q99PL6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubxn6Q99PL6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubxn6Q99PL6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubxn6Q99PL6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ubxn6Q99PL6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubxn6Q99PL6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubxn6Q99PL6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubxn6Q99PL6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubxn6Q99PL6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubxn6Q99PL6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubxn6Q99PL6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubxn6Q99PL6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubxn6Q99PL6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ubxn6Q99PL6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ubxn6Q99PL6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ubxn6Q99PL6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ubxn6Q99PL6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ubxn6Q99PL6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ubxn6Q99PL6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ubxn6Q99PL6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ubxn6Q99PL6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ubxn6Q99PL6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ubxn6Q99PL6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ubxn6Q99PL6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ubxn6Q99PL6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ubxn6Q99PL6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ubxn6Q99PL6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ubxn6Q99PL6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ubxn6Q99PL6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubxn6Q99PL6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ubxn6Q99PL6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubxn6Q99PL6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ubxn6Q99PL6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ubxn6Q99PL6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubxn6Q99PL6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubxn6Q99PL6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubxn6Q99PL6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubxn6Q99PL6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubxn6Q99PL6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms