Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rassf3Q99P51 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rassf3Q99P51 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
Rassf3Q99P51 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rassf3Q99P51 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rassf3Q99P51 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rassf3Q99P51 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Rassf3Q99P51 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Rassf3Q99P51 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Rassf3Q99P51 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Rassf3Q99P51 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rassf3Q99P51 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rassf3Q99P51 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rassf3Q99P51 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rassf3Q99P51 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rassf3Q99P51 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rassf3Q99P51 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Rassf3Q99P51 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rassf3Q99P51 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rassf3Q99P51 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rassf3Q99P51 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rassf3Q99P51 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rassf3Q99P51 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rassf3Q99P51 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rassf3Q99P51 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rassf3Q99P51 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rassf3Q99P51 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Rassf3Q99P51 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rassf3Q99P51 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Rassf3Q99P51 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rassf3Q99P51 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rassf3Q99P51 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rassf3Q99P51 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rassf3Q99P51 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rassf3Q99P51 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rassf3Q99P51 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rassf3Q99P51 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rassf3Q99P51 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rassf3Q99P51 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rassf3Q99P51 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rassf3Q99P51 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Rassf3Q99P51 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Rassf3Q99P51 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rassf3Q99P51 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Rassf3Q99P51 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rassf3Q99P51 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rassf3Q99P51 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rassf3Q99P51 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rassf3Q99P51 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rassf3Q99P51 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rassf3Q99P51 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rassf3Q99P51 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rassf3Q99P51 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Rassf3Q99P51 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Rassf3Q99P51 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rassf3Q99P51 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rassf3Q99P51 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Rassf3Q99P51 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rassf3Q99P51 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rassf3Q99P51 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rassf3Q99P51 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rassf3Q99P51 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Rassf3Q99P51 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rassf3Q99P51 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rassf3Q99P51 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rassf3Q99P51 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rassf3Q99P51 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rassf3Q99P51 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Rassf3Q99P51 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rassf3Q99P51 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rassf3Q99P51 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rassf3Q99P51 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rassf3Q99P51 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rassf3Q99P51 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rassf3Q99P51 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rassf3Q99P51 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Rassf3Q99P51 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rassf3Q99P51 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rassf3Q99P51 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rassf3Q99P51 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rassf3Q99P51 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rassf3Q99P51 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rassf3Q99P51 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rassf3Q99P51 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rassf3Q99P51 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rassf3Q99P51 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rassf3Q99P51 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rassf3Q99P51 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rassf3Q99P51 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rassf3Q99P51 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rassf3Q99P51 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rassf3Q99P51 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rassf3Q99P51 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rassf3Q99P51 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rassf3Q99P51 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Rassf3Q99P51 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rassf3Q99P51 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rassf3Q99P51 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rassf3Q99P51 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rassf3Q99P51 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms