Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,88■■□□□ 1,09
Ms4a6bQ99N09 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Ms4a6bQ99N09 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Ms4a6bQ99N09 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Ms4a6bQ99N09 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Ms4a6bQ99N09 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Ms4a6bQ99N09 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Ms4a6bQ99N09 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Ms4a6bQ99N09 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Ms4a6bQ99N09 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Ms4a6bQ99N09 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,71■■□□□ 1,07
Ms4a6bQ99N09 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21,71■■□□□ 1,07
Ms4a6bQ99N09 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Ms4a6bQ99N09 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21,69■■□□□ 1,06
Ms4a6bQ99N09 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Ms4a6bQ99N09 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Ms4a6bQ99N09 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Ms4a6bQ99N09 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Ms4a6bQ99N09 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21,62■■□□□ 1,05
Ms4a6bQ99N09 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21,55■■□□□ 1,04
Ms4a6bQ99N09 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Ms4a6bQ99N09 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Ms4a6bQ99N09 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Ms4a6bQ99N09 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Ms4a6bQ99N09 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Ms4a6bQ99N09 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,44■■□□□ 1,02
Ms4a6bQ99N09 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Ms4a6bQ99N09 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Ms4a6bQ99N09 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Ms4a6bQ99N09 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21,4■■□□□ 1,02
Ms4a6bQ99N09 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Ms4a6bQ99N09 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Ms4a6bQ99N09 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Ms4a6bQ99N09 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Ms4a6bQ99N09 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21,35■■□□□ 1,01
Ms4a6bQ99N09 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Ms4a6bQ99N09 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21,35■■□□□ 1,01
Ms4a6bQ99N09 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Ms4a6bQ99N09 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Ms4a6bQ99N09 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Ms4a6bQ99N09 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Ms4a6bQ99N09 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,3■■□□□ 1
Ms4a6bQ99N09 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21,3■■□□□ 1
Ms4a6bQ99N09 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Ms4a6bQ99N09 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21,26■□□□□ 0,99
Ms4a6bQ99N09 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Ms4a6bQ99N09 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Ms4a6bQ99N09 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21,23■□□□□ 0,99
Ms4a6bQ99N09 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Ms4a6bQ99N09 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Ms4a6bQ99N09 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Ms4a6bQ99N09 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Ms4a6bQ99N09 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Ms4a6bQ99N09 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Ms4a6bQ99N09 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ms4a6bQ99N09 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ms4a6bQ99N09 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ms4a6bQ99N09 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Ms4a6bQ99N09 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Ms4a6bQ99N09 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21,11■□□□□ 0,97
Ms4a6bQ99N09 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21,1■□□□□ 0,97
Ms4a6bQ99N09 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Ms4a6bQ99N09 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Ms4a6bQ99N09 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Ms4a6bQ99N09 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ms4a6bQ99N09 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Ms4a6bQ99N09 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Ms4a6bQ99N09 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Ms4a6bQ99N09 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Ms4a6bQ99N09 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Ms4a6bQ99N09 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Ms4a6bQ99N09 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Ms4a6bQ99N09 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21,02■□□□□ 0,96
Ms4a6bQ99N09 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Ms4a6bQ99N09 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Ms4a6bQ99N09 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
Ms4a6bQ99N09 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
Ms4a6bQ99N09 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Ms4a6bQ99N09 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Ms4a6bQ99N09 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20,98■□□□□ 0,95
Ms4a6bQ99N09 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Ms4a6bQ99N09 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Ms4a6bQ99N09 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ms4a6bQ99N09 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Ms4a6bQ99N09 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Ms4a6bQ99N09 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Ms4a6bQ99N09 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20,93■□□□□ 0,94
Ms4a6bQ99N09 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,92■□□□□ 0,94
Ms4a6bQ99N09 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20,91■□□□□ 0,94
Ms4a6bQ99N09 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Ms4a6bQ99N09 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20,9■□□□□ 0,94
Ms4a6bQ99N09 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Ms4a6bQ99N09 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Ms4a6bQ99N09 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Ms4a6bQ99N09 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ms4a6bQ99N09 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Ms4a6bQ99N09 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,86■□□□□ 0,93
Ms4a6bQ99N09 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Ms4a6bQ99N09 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Ms4a6bQ99N09 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms