Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a6cQ99N08 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a6cQ99N08 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a6cQ99N08 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a6cQ99N08 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a6cQ99N08 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a6cQ99N08 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ms4a6cQ99N08 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a6cQ99N08 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a6cQ99N08 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a6cQ99N08 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a6cQ99N08 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a6cQ99N08 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a6cQ99N08 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a6cQ99N08 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a6cQ99N08 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a6cQ99N08 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a6cQ99N08 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a6cQ99N08 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a6cQ99N08 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a6cQ99N08 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a6cQ99N08 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a6cQ99N08 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a6cQ99N08 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a6cQ99N08 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a6cQ99N08 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a6cQ99N08 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a6cQ99N08 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a6cQ99N08 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a6cQ99N08 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a6cQ99N08 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a6cQ99N08 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a6cQ99N08 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a6cQ99N08 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a6cQ99N08 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a6cQ99N08 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a6cQ99N08 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a6cQ99N08 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a6cQ99N08 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a6cQ99N08 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a6cQ99N08 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a6cQ99N08 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a6cQ99N08 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a6cQ99N08 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a6cQ99N08 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a6cQ99N08 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a6cQ99N08 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a6cQ99N08 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a6cQ99N08 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ms4a6cQ99N08 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a6cQ99N08 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a6cQ99N08 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a6cQ99N08 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a6cQ99N08 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ms4a6cQ99N08 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a6cQ99N08 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a6cQ99N08 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ms4a6cQ99N08 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ms4a6cQ99N08 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a6cQ99N08 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a6cQ99N08 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a6cQ99N08 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a6cQ99N08 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a6cQ99N08 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a6cQ99N08 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a6cQ99N08 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a6cQ99N08 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a6cQ99N08 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a6cQ99N08 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a6cQ99N08 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a6cQ99N08 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a6cQ99N08 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a6cQ99N08 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a6cQ99N08 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ms4a6cQ99N08 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a6cQ99N08 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a6cQ99N08 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a6cQ99N08 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a6cQ99N08 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a6cQ99N08 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a6cQ99N08 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a6cQ99N08 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a6cQ99N08 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a6cQ99N08 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ms4a6cQ99N08 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a6cQ99N08 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a6cQ99N08 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a6cQ99N08 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a6cQ99N08 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a6cQ99N08 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a6cQ99N08 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a6cQ99N08 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ms4a6cQ99N08 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ms4a6cQ99N08 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ms4a6cQ99N08 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ms4a6cQ99N08 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ms4a6cQ99N08 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ms4a6cQ99N08 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a6cQ99N08 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ms4a6cQ99N08 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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