Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ms4a6dQ99N07 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a6dQ99N07 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ms4a6dQ99N07 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a6dQ99N07 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ms4a6dQ99N07 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ms4a6dQ99N07 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ms4a6dQ99N07 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a6dQ99N07 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a6dQ99N07 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a6dQ99N07 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a6dQ99N07 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ms4a6dQ99N07 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ms4a6dQ99N07 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a6dQ99N07 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a6dQ99N07 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a6dQ99N07 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a6dQ99N07 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a6dQ99N07 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a6dQ99N07 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a6dQ99N07 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a6dQ99N07 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a6dQ99N07 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ms4a6dQ99N07 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a6dQ99N07 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a6dQ99N07 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ms4a6dQ99N07 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a6dQ99N07 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a6dQ99N07 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a6dQ99N07 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a6dQ99N07 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a6dQ99N07 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a6dQ99N07 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a6dQ99N07 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a6dQ99N07 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a6dQ99N07 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a6dQ99N07 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a6dQ99N07 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a6dQ99N07 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a6dQ99N07 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a6dQ99N07 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a6dQ99N07 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a6dQ99N07 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a6dQ99N07 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a6dQ99N07 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a6dQ99N07 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a6dQ99N07 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a6dQ99N07 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a6dQ99N07 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a6dQ99N07 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a6dQ99N07 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a6dQ99N07 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a6dQ99N07 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a6dQ99N07 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a6dQ99N07 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a6dQ99N07 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ms4a6dQ99N07 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a6dQ99N07 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a6dQ99N07 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a6dQ99N07 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ms4a6dQ99N07 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a6dQ99N07 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a6dQ99N07 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a6dQ99N07 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a6dQ99N07 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a6dQ99N07 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ms4a6dQ99N07 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a6dQ99N07 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a6dQ99N07 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a6dQ99N07 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ms4a6dQ99N07 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a6dQ99N07 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a6dQ99N07 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a6dQ99N07 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a6dQ99N07 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a6dQ99N07 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a6dQ99N07 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a6dQ99N07 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a6dQ99N07 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a6dQ99N07 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a6dQ99N07 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a6dQ99N07 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a6dQ99N07 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a6dQ99N07 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a6dQ99N07 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a6dQ99N07 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a6dQ99N07 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a6dQ99N07 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a6dQ99N07 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a6dQ99N07 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a6dQ99N07 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a6dQ99N07 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a6dQ99N07 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a6dQ99N07 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a6dQ99N07 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a6dQ99N07 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a6dQ99N07 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a6dQ99N07 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a6dQ99N07 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a6dQ99N07 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
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