Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Ms4a6dQ99N07 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Ms4a6dQ99N07 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22,29■■□□□ 1,16
Ms4a6dQ99N07 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,28■■□□□ 1,16
Ms4a6dQ99N07 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Ms4a6dQ99N07 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Ms4a6dQ99N07 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Ms4a6dQ99N07 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,25■■□□□ 1,15
Ms4a6dQ99N07 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Ms4a6dQ99N07 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,24■■□□□ 1,15
Ms4a6dQ99N07 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Ms4a6dQ99N07 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Ms4a6dQ99N07 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22,2■■□□□ 1,14
Ms4a6dQ99N07 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Ms4a6dQ99N07 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Ms4a6dQ99N07 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,15■■□□□ 1,14
Ms4a6dQ99N07 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,12■■□□□ 1,13
Ms4a6dQ99N07 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,09■■□□□ 1,13
Ms4a6dQ99N07 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22,07■■□□□ 1,12
Ms4a6dQ99N07 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Ms4a6dQ99N07 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Ms4a6dQ99N07 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Ms4a6dQ99N07 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Ms4a6dQ99N07 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Ms4a6dQ99N07 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Ms4a6dQ99N07 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Ms4a6dQ99N07 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Ms4a6dQ99N07 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21,98■■□□□ 1,11
Ms4a6dQ99N07 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Ms4a6dQ99N07 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Ms4a6dQ99N07 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Ms4a6dQ99N07 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Ms4a6dQ99N07 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Ms4a6dQ99N07 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Ms4a6dQ99N07 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21,88■■□□□ 1,09
Ms4a6dQ99N07 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Ms4a6dQ99N07 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Ms4a6dQ99N07 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21,85■■□□□ 1,09
Ms4a6dQ99N07 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21,83■■□□□ 1,09
Ms4a6dQ99N07 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Ms4a6dQ99N07 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Ms4a6dQ99N07 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Ms4a6dQ99N07 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Ms4a6dQ99N07 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Ms4a6dQ99N07 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Ms4a6dQ99N07 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,72■■□□□ 1,07
Ms4a6dQ99N07 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Ms4a6dQ99N07 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Ms4a6dQ99N07 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21,71■■□□□ 1,07
Ms4a6dQ99N07 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,7■■□□□ 1,06
Ms4a6dQ99N07 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Ms4a6dQ99N07 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Ms4a6dQ99N07 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21,66■■□□□ 1,06
Ms4a6dQ99N07 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Ms4a6dQ99N07 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Ms4a6dQ99N07 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Ms4a6dQ99N07 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21,63■■□□□ 1,05
Ms4a6dQ99N07 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Ms4a6dQ99N07 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
Ms4a6dQ99N07 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21,58■■□□□ 1,04
Ms4a6dQ99N07 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Ms4a6dQ99N07 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21,56■■□□□ 1,04
Ms4a6dQ99N07 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Ms4a6dQ99N07 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Ms4a6dQ99N07 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Ms4a6dQ99N07 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Ms4a6dQ99N07 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21,53■■□□□ 1,04
Ms4a6dQ99N07 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Ms4a6dQ99N07 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Ms4a6dQ99N07 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,52■■□□□ 1,03
Ms4a6dQ99N07 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Ms4a6dQ99N07 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21,47■■□□□ 1,03
Ms4a6dQ99N07 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Ms4a6dQ99N07 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Ms4a6dQ99N07 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21,45■■□□□ 1,02
Ms4a6dQ99N07 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Ms4a6dQ99N07 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Ms4a6dQ99N07 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21,41■■□□□ 1,02
Ms4a6dQ99N07 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Ms4a6dQ99N07 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Ms4a6dQ99N07 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Ms4a6dQ99N07 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21,37■■□□□ 1,01
Ms4a6dQ99N07 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Ms4a6dQ99N07 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21,35■■□□□ 1,01
Ms4a6dQ99N07 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Ms4a6dQ99N07 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Ms4a6dQ99N07 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Ms4a6dQ99N07 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Ms4a6dQ99N07 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Ms4a6dQ99N07 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21,27■■□□□ 1
Ms4a6dQ99N07 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,26■□□□□ 0,99
Ms4a6dQ99N07 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,24■□□□□ 0,99
Ms4a6dQ99N07 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Ms4a6dQ99N07 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Ms4a6dQ99N07 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21,2■□□□□ 0,98
Ms4a6dQ99N07 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Ms4a6dQ99N07 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21,19■□□□□ 0,98
Ms4a6dQ99N07 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21,19■□□□□ 0,98
Ms4a6dQ99N07 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,18■□□□□ 0,98
Ms4a6dQ99N07 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21,18■□□□□ 0,98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,5 ms