Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI8

Hgs, Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HgsQ99LI8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
HgsQ99LI8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HgsQ99LI8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HgsQ99LI8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
HgsQ99LI8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HgsQ99LI8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HgsQ99LI8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HgsQ99LI8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HgsQ99LI8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HgsQ99LI8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HgsQ99LI8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HgsQ99LI8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HgsQ99LI8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HgsQ99LI8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HgsQ99LI8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HgsQ99LI8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HgsQ99LI8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HgsQ99LI8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HgsQ99LI8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HgsQ99LI8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HgsQ99LI8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HgsQ99LI8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HgsQ99LI8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HgsQ99LI8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HgsQ99LI8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HgsQ99LI8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HgsQ99LI8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HgsQ99LI8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HgsQ99LI8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HgsQ99LI8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HgsQ99LI8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HgsQ99LI8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HgsQ99LI8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HgsQ99LI8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HgsQ99LI8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HgsQ99LI8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HgsQ99LI8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HgsQ99LI8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HgsQ99LI8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HgsQ99LI8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HgsQ99LI8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HgsQ99LI8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HgsQ99LI8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HgsQ99LI8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HgsQ99LI8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HgsQ99LI8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HgsQ99LI8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HgsQ99LI8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HgsQ99LI8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HgsQ99LI8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HgsQ99LI8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HgsQ99LI8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HgsQ99LI8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HgsQ99LI8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HgsQ99LI8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HgsQ99LI8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HgsQ99LI8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HgsQ99LI8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HgsQ99LI8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HgsQ99LI8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HgsQ99LI8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HgsQ99LI8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28■■■□□ 2.07
HgsQ99LI8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HgsQ99LI8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HgsQ99LI8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HgsQ99LI8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HgsQ99LI8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HgsQ99LI8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HgsQ99LI8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HgsQ99LI8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HgsQ99LI8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HgsQ99LI8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HgsQ99LI8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HgsQ99LI8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HgsQ99LI8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HgsQ99LI8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HgsQ99LI8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HgsQ99LI8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HgsQ99LI8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HgsQ99LI8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HgsQ99LI8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HgsQ99LI8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HgsQ99LI8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HgsQ99LI8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HgsQ99LI8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HgsQ99LI8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HgsQ99LI8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HgsQ99LI8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HgsQ99LI8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HgsQ99LI8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HgsQ99LI8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HgsQ99LI8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HgsQ99LI8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HgsQ99LI8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HgsQ99LI8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HgsQ99LI8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HgsQ99LI8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HgsQ99LI8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HgsQ99LI8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HgsQ99LI8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms