Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lactb2Q99KR3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lactb2Q99KR3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lactb2Q99KR3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Lactb2Q99KR3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lactb2Q99KR3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Lactb2Q99KR3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lactb2Q99KR3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lactb2Q99KR3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lactb2Q99KR3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lactb2Q99KR3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lactb2Q99KR3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lactb2Q99KR3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lactb2Q99KR3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lactb2Q99KR3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lactb2Q99KR3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lactb2Q99KR3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lactb2Q99KR3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lactb2Q99KR3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lactb2Q99KR3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lactb2Q99KR3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lactb2Q99KR3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lactb2Q99KR3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lactb2Q99KR3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lactb2Q99KR3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lactb2Q99KR3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lactb2Q99KR3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lactb2Q99KR3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lactb2Q99KR3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lactb2Q99KR3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lactb2Q99KR3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lactb2Q99KR3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lactb2Q99KR3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lactb2Q99KR3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Lactb2Q99KR3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lactb2Q99KR3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lactb2Q99KR3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lactb2Q99KR3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lactb2Q99KR3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lactb2Q99KR3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lactb2Q99KR3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lactb2Q99KR3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lactb2Q99KR3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lactb2Q99KR3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lactb2Q99KR3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lactb2Q99KR3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lactb2Q99KR3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lactb2Q99KR3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lactb2Q99KR3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lactb2Q99KR3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lactb2Q99KR3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lactb2Q99KR3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lactb2Q99KR3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lactb2Q99KR3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Lactb2Q99KR3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lactb2Q99KR3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Lactb2Q99KR3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Lactb2Q99KR3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lactb2Q99KR3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Lactb2Q99KR3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lactb2Q99KR3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lactb2Q99KR3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Lactb2Q99KR3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lactb2Q99KR3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lactb2Q99KR3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lactb2Q99KR3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lactb2Q99KR3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lactb2Q99KR3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lactb2Q99KR3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lactb2Q99KR3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lactb2Q99KR3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lactb2Q99KR3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lactb2Q99KR3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lactb2Q99KR3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lactb2Q99KR3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lactb2Q99KR3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lactb2Q99KR3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Lactb2Q99KR3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lactb2Q99KR3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lactb2Q99KR3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lactb2Q99KR3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lactb2Q99KR3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lactb2Q99KR3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lactb2Q99KR3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lactb2Q99KR3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lactb2Q99KR3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lactb2Q99KR3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lactb2Q99KR3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lactb2Q99KR3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lactb2Q99KR3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lactb2Q99KR3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lactb2Q99KR3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lactb2Q99KR3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lactb2Q99KR3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lactb2Q99KR3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lactb2Q99KR3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Lactb2Q99KR3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lactb2Q99KR3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lactb2Q99KR3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lactb2Q99KR3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms