Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg5Q99J83 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg5Q99J83 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg5Q99J83 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg5Q99J83 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg5Q99J83 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg5Q99J83 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg5Q99J83 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atg5Q99J83 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg5Q99J83 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg5Q99J83 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg5Q99J83 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg5Q99J83 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg5Q99J83 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg5Q99J83 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg5Q99J83 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg5Q99J83 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg5Q99J83 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg5Q99J83 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg5Q99J83 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg5Q99J83 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg5Q99J83 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg5Q99J83 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg5Q99J83 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg5Q99J83 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg5Q99J83 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Atg5Q99J83 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg5Q99J83 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg5Q99J83 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg5Q99J83 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg5Q99J83 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg5Q99J83 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg5Q99J83 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg5Q99J83 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg5Q99J83 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg5Q99J83 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg5Q99J83 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg5Q99J83 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg5Q99J83 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg5Q99J83 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg5Q99J83 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg5Q99J83 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg5Q99J83 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg5Q99J83 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg5Q99J83 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg5Q99J83 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg5Q99J83 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg5Q99J83 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg5Q99J83 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg5Q99J83 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg5Q99J83 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg5Q99J83 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg5Q99J83 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg5Q99J83 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg5Q99J83 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg5Q99J83 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg5Q99J83 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg5Q99J83 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg5Q99J83 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg5Q99J83 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg5Q99J83 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg5Q99J83 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg5Q99J83 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg5Q99J83 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg5Q99J83 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg5Q99J83 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg5Q99J83 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg5Q99J83 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg5Q99J83 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg5Q99J83 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg5Q99J83 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg5Q99J83 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg5Q99J83 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg5Q99J83 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg5Q99J83 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg5Q99J83 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg5Q99J83 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg5Q99J83 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg5Q99J83 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg5Q99J83 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg5Q99J83 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg5Q99J83 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg5Q99J83 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg5Q99J83 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg5Q99J83 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg5Q99J83 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg5Q99J83 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg5Q99J83 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg5Q99J83 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg5Q99J83 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg5Q99J83 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg5Q99J83 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg5Q99J83 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg5Q99J83 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg5Q99J83 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg5Q99J83 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg5Q99J83 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atg5Q99J83 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg5Q99J83 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg5Q99J83 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms