Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31,65■■■□□ 2,66
Apobec3Q99J72 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Apobec3Q99J72 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,64■■■□□ 2,66
Apobec3Q99J72 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31,62■■■□□ 2,65
Apobec3Q99J72 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Apobec3Q99J72 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Apobec3Q99J72 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Apobec3Q99J72 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Apobec3Q99J72 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Apobec3Q99J72 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31,47■■■□□ 2,63
Apobec3Q99J72 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Apobec3Q99J72 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Apobec3Q99J72 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Apobec3Q99J72 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Apobec3Q99J72 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Apobec3Q99J72 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Apobec3Q99J72 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31,35■■■□□ 2,61
Apobec3Q99J72 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Apobec3Q99J72 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,6
Apobec3Q99J72 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Apobec3Q99J72 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Apobec3Q99J72 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Apobec3Q99J72 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31,23■■■□□ 2,59
Apobec3Q99J72 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Apobec3Q99J72 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Apobec3Q99J72 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Apobec3Q99J72 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Apobec3Q99J72 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Apobec3Q99J72 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Apobec3Q99J72 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Apobec3Q99J72 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Apobec3Q99J72 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Apobec3Q99J72 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Apobec3Q99J72 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,99■■■□□ 2,55
Apobec3Q99J72 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Apobec3Q99J72 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30,97■■■□□ 2,55
Apobec3Q99J72 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Apobec3Q99J72 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,85■■■□□ 2,53
Apobec3Q99J72 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Apobec3Q99J72 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Apobec3Q99J72 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Apobec3Q99J72 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Apobec3Q99J72 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Apobec3Q99J72 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Apobec3Q99J72 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
Apobec3Q99J72 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Apobec3Q99J72 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Apobec3Q99J72 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Apobec3Q99J72 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Apobec3Q99J72 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Apobec3Q99J72 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Apobec3Q99J72 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Apobec3Q99J72 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Apobec3Q99J72 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,6■■■□□ 2,49
Apobec3Q99J72 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Apobec3Q99J72 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Apobec3Q99J72 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30,55■■■□□ 2,48
Apobec3Q99J72 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Apobec3Q99J72 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
Apobec3Q99J72 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
Apobec3Q99J72 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30,51■■■□□ 2,47
Apobec3Q99J72 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Apobec3Q99J72 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30,49■■■□□ 2,47
Apobec3Q99J72 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Apobec3Q99J72 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Apobec3Q99J72 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Apobec3Q99J72 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,45■■■□□ 2,47
Apobec3Q99J72 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Apobec3Q99J72 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Apobec3Q99J72 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Apobec3Q99J72 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Apobec3Q99J72 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Apobec3Q99J72 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Apobec3Q99J72 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Apobec3Q99J72 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,36■■■□□ 2,45
Apobec3Q99J72 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Apobec3Q99J72 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Apobec3Q99J72 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Apobec3Q99J72 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Apobec3Q99J72 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Apobec3Q99J72 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Apobec3Q99J72 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Apobec3Q99J72 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Apobec3Q99J72 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30,17■■■□□ 2,42
Apobec3Q99J72 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Apobec3Q99J72 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30,11■■■□□ 2,41
Apobec3Q99J72 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Apobec3Q99J72 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Apobec3Q99J72 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Apobec3Q99J72 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Apobec3Q99J72 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Apobec3Q99J72 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Apobec3Q99J72 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Apobec3Q99J72 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Apobec3Q99J72 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Apobec3Q99J72 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Apobec3Q99J72 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Apobec3Q99J72 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Apobec3Q99J72 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Apobec3Q99J72 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,6 ms