Protein–RNA interactions for Protein: Q99246

Cacna1d, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, mousemouse

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1dQ99246 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Cacna1dQ99246 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Cacna1dQ99246 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Cacna1dQ99246 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Cacna1dQ99246 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
Cacna1dQ99246 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Cacna1dQ99246 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Cacna1dQ99246 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Cacna1dQ99246 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Cacna1dQ99246 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Cacna1dQ99246 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Cacna1dQ99246 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Cacna1dQ99246 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Cacna1dQ99246 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Cacna1dQ99246 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Cacna1dQ99246 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Cacna1dQ99246 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27,8■■■□□ 2,04
Cacna1dQ99246 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Cacna1dQ99246 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Cacna1dQ99246 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Cacna1dQ99246 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Cacna1dQ99246 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Cacna1dQ99246 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Cacna1dQ99246 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Cacna1dQ99246 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Cacna1dQ99246 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Cacna1dQ99246 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Cacna1dQ99246 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27,6■■■□□ 2,01
Cacna1dQ99246 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Cacna1dQ99246 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Cacna1dQ99246 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Cacna1dQ99246 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,54■■■□□ 2
Cacna1dQ99246 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Cacna1dQ99246 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Cacna1dQ99246 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Cacna1dQ99246 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Cacna1dQ99246 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Cacna1dQ99246 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Cacna1dQ99246 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Cacna1dQ99246 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Cacna1dQ99246 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Cacna1dQ99246 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Cacna1dQ99246 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Cacna1dQ99246 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Cacna1dQ99246 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Cacna1dQ99246 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Cacna1dQ99246 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Cacna1dQ99246 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,28■■□□□ 1,96
Cacna1dQ99246 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,28■■□□□ 1,96
Cacna1dQ99246 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,27■■□□□ 1,96
Cacna1dQ99246 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Cacna1dQ99246 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Cacna1dQ99246 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cacna1dQ99246 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cacna1dQ99246 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cacna1dQ99246 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cacna1dQ99246 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Cacna1dQ99246 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Cacna1dQ99246 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Cacna1dQ99246 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Cacna1dQ99246 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Cacna1dQ99246 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Cacna1dQ99246 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Cacna1dQ99246 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Cacna1dQ99246 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Cacna1dQ99246 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Cacna1dQ99246 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Cacna1dQ99246 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Cacna1dQ99246 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
Cacna1dQ99246 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,92
Cacna1dQ99246 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
Cacna1dQ99246 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Cacna1dQ99246 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Cacna1dQ99246 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Cacna1dQ99246 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Cacna1dQ99246 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Cacna1dQ99246 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Cacna1dQ99246 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Cacna1dQ99246 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Cacna1dQ99246 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Cacna1dQ99246 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Cacna1dQ99246 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Cacna1dQ99246 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Cacna1dQ99246 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Cacna1dQ99246 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Cacna1dQ99246 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Cacna1dQ99246 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Cacna1dQ99246 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26,69■■□□□ 1,86
Cacna1dQ99246 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26,67■■□□□ 1,86
Cacna1dQ99246 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Cacna1dQ99246 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Cacna1dQ99246 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Cacna1dQ99246 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,61■■□□□ 1,85
Cacna1dQ99246 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Cacna1dQ99246 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26,6■■□□□ 1,85
Cacna1dQ99246 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Cacna1dQ99246 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Cacna1dQ99246 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Cacna1dQ99246 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Cacna1dQ99246 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70,7 ms