Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc8b1Q925Q3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc8b1Q925Q3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc8b1Q925Q3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Slc8b1Q925Q3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc8b1Q925Q3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc8b1Q925Q3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc8b1Q925Q3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc8b1Q925Q3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc8b1Q925Q3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc8b1Q925Q3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc8b1Q925Q3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc8b1Q925Q3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc8b1Q925Q3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc8b1Q925Q3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc8b1Q925Q3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc8b1Q925Q3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc8b1Q925Q3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc8b1Q925Q3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc8b1Q925Q3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc8b1Q925Q3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc8b1Q925Q3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc8b1Q925Q3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slc8b1Q925Q3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slc8b1Q925Q3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc8b1Q925Q3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slc8b1Q925Q3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc8b1Q925Q3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc8b1Q925Q3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc8b1Q925Q3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc8b1Q925Q3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc8b1Q925Q3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc8b1Q925Q3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc8b1Q925Q3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc8b1Q925Q3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc8b1Q925Q3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc8b1Q925Q3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc8b1Q925Q3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc8b1Q925Q3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc8b1Q925Q3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc8b1Q925Q3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc8b1Q925Q3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc8b1Q925Q3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc8b1Q925Q3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc8b1Q925Q3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc8b1Q925Q3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc8b1Q925Q3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc8b1Q925Q3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc8b1Q925Q3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc8b1Q925Q3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc8b1Q925Q3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc8b1Q925Q3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc8b1Q925Q3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc8b1Q925Q3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc8b1Q925Q3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc8b1Q925Q3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc8b1Q925Q3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc8b1Q925Q3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc8b1Q925Q3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc8b1Q925Q3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc8b1Q925Q3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc8b1Q925Q3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc8b1Q925Q3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc8b1Q925Q3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc8b1Q925Q3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc8b1Q925Q3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc8b1Q925Q3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc8b1Q925Q3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc8b1Q925Q3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc8b1Q925Q3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc8b1Q925Q3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc8b1Q925Q3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc8b1Q925Q3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc8b1Q925Q3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc8b1Q925Q3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc8b1Q925Q3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc8b1Q925Q3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc8b1Q925Q3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc8b1Q925Q3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc8b1Q925Q3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc8b1Q925Q3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc8b1Q925Q3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc8b1Q925Q3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc8b1Q925Q3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc8b1Q925Q3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc8b1Q925Q3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc8b1Q925Q3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc8b1Q925Q3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc8b1Q925Q3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc8b1Q925Q3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc8b1Q925Q3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc8b1Q925Q3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc8b1Q925Q3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc8b1Q925Q3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc8b1Q925Q3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc8b1Q925Q3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc8b1Q925Q3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc8b1Q925Q3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc8b1Q925Q3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc8b1Q925Q3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms