Protein–RNA interactions for Protein: Q921W0

Chmp1a, Charged multivesicular body protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1aQ921W0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp1aQ921W0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp1aQ921W0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp1aQ921W0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp1aQ921W0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp1aQ921W0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp1aQ921W0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp1aQ921W0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp1aQ921W0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp1aQ921W0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp1aQ921W0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp1aQ921W0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp1aQ921W0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp1aQ921W0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp1aQ921W0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp1aQ921W0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp1aQ921W0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp1aQ921W0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp1aQ921W0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp1aQ921W0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp1aQ921W0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp1aQ921W0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp1aQ921W0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp1aQ921W0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp1aQ921W0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp1aQ921W0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp1aQ921W0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp1aQ921W0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp1aQ921W0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp1aQ921W0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chmp1aQ921W0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp1aQ921W0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp1aQ921W0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp1aQ921W0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp1aQ921W0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp1aQ921W0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp1aQ921W0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp1aQ921W0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp1aQ921W0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp1aQ921W0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp1aQ921W0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp1aQ921W0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp1aQ921W0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp1aQ921W0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp1aQ921W0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp1aQ921W0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp1aQ921W0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp1aQ921W0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp1aQ921W0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp1aQ921W0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp1aQ921W0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp1aQ921W0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp1aQ921W0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp1aQ921W0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp1aQ921W0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp1aQ921W0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp1aQ921W0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp1aQ921W0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp1aQ921W0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp1aQ921W0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp1aQ921W0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp1aQ921W0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp1aQ921W0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp1aQ921W0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp1aQ921W0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp1aQ921W0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp1aQ921W0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp1aQ921W0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp1aQ921W0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp1aQ921W0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp1aQ921W0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp1aQ921W0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp1aQ921W0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chmp1aQ921W0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp1aQ921W0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp1aQ921W0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp1aQ921W0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp1aQ921W0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp1aQ921W0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp1aQ921W0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp1aQ921W0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp1aQ921W0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp1aQ921W0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp1aQ921W0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp1aQ921W0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp1aQ921W0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp1aQ921W0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp1aQ921W0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp1aQ921W0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp1aQ921W0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp1aQ921W0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp1aQ921W0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp1aQ921W0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp1aQ921W0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp1aQ921W0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp1aQ921W0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp1aQ921W0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chmp1aQ921W0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp1aQ921W0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp1aQ921W0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms