Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR1

Rab4b, Ras-related protein Rab-4B, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4bQ91ZR1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21,35■■□□□ 1,01
Rab4bQ91ZR1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1
Rab4bQ91ZR1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Rab4bQ91ZR1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Rab4bQ91ZR1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Rab4bQ91ZR1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Rab4bQ91ZR1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Rab4bQ91ZR1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Rab4bQ91ZR1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Rab4bQ91ZR1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Rab4bQ91ZR1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Rab4bQ91ZR1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Rab4bQ91ZR1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,16■□□□□ 0,98
Rab4bQ91ZR1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Rab4bQ91ZR1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Rab4bQ91ZR1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Rab4bQ91ZR1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Rab4bQ91ZR1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Rab4bQ91ZR1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Rab4bQ91ZR1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21,07■□□□□ 0,96
Rab4bQ91ZR1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Rab4bQ91ZR1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Rab4bQ91ZR1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Rab4bQ91ZR1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Rab4bQ91ZR1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Rab4bQ91ZR1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Rab4bQ91ZR1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Rab4bQ91ZR1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Rab4bQ91ZR1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
Rab4bQ91ZR1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Rab4bQ91ZR1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Rab4bQ91ZR1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Rab4bQ91ZR1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Rab4bQ91ZR1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Rab4bQ91ZR1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Rab4bQ91ZR1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Rab4bQ91ZR1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Rab4bQ91ZR1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Rab4bQ91ZR1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Rab4bQ91ZR1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Rab4bQ91ZR1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Rab4bQ91ZR1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Rab4bQ91ZR1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Rab4bQ91ZR1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Rab4bQ91ZR1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Rab4bQ91ZR1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Rab4bQ91ZR1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Rab4bQ91ZR1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Rab4bQ91ZR1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Rab4bQ91ZR1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Rab4bQ91ZR1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20,76■□□□□ 0,91
Rab4bQ91ZR1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Rab4bQ91ZR1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Rab4bQ91ZR1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Rab4bQ91ZR1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Rab4bQ91ZR1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Rab4bQ91ZR1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Rab4bQ91ZR1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Rab4bQ91ZR1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20,71■□□□□ 0,91
Rab4bQ91ZR1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Rab4bQ91ZR1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20,71■□□□□ 0,91
Rab4bQ91ZR1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Rab4bQ91ZR1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Rab4bQ91ZR1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Rab4bQ91ZR1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Rab4bQ91ZR1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
Rab4bQ91ZR1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Rab4bQ91ZR1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Rab4bQ91ZR1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Rab4bQ91ZR1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Rab4bQ91ZR1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Rab4bQ91ZR1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
Rab4bQ91ZR1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Rab4bQ91ZR1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Rab4bQ91ZR1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,56■□□□□ 0,88
Rab4bQ91ZR1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Rab4bQ91ZR1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Rab4bQ91ZR1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,52■□□□□ 0,88
Rab4bQ91ZR1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Rab4bQ91ZR1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20,5■□□□□ 0,87
Rab4bQ91ZR1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Rab4bQ91ZR1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20,48■□□□□ 0,87
Rab4bQ91ZR1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20,47■□□□□ 0,87
Rab4bQ91ZR1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Rab4bQ91ZR1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Rab4bQ91ZR1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Rab4bQ91ZR1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Rab4bQ91ZR1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Rab4bQ91ZR1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Rab4bQ91ZR1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20,4■□□□□ 0,86
Rab4bQ91ZR1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Rab4bQ91ZR1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Rab4bQ91ZR1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Rab4bQ91ZR1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Rab4bQ91ZR1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Rab4bQ91ZR1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,38■□□□□ 0,85
Rab4bQ91ZR1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Rab4bQ91ZR1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Rab4bQ91ZR1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Rab4bQ91ZR1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20,35■□□□□ 0,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,4 ms