Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pde6cQ91ZQ1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pde6cQ91ZQ1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pde6cQ91ZQ1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pde6cQ91ZQ1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pde6cQ91ZQ1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pde6cQ91ZQ1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Pde6cQ91ZQ1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Pde6cQ91ZQ1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pde6cQ91ZQ1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Pde6cQ91ZQ1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pde6cQ91ZQ1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pde6cQ91ZQ1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pde6cQ91ZQ1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pde6cQ91ZQ1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pde6cQ91ZQ1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pde6cQ91ZQ1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pde6cQ91ZQ1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pde6cQ91ZQ1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Pde6cQ91ZQ1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Pde6cQ91ZQ1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pde6cQ91ZQ1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pde6cQ91ZQ1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pde6cQ91ZQ1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pde6cQ91ZQ1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pde6cQ91ZQ1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pde6cQ91ZQ1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pde6cQ91ZQ1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pde6cQ91ZQ1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Pde6cQ91ZQ1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pde6cQ91ZQ1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pde6cQ91ZQ1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pde6cQ91ZQ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pde6cQ91ZQ1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pde6cQ91ZQ1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pde6cQ91ZQ1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pde6cQ91ZQ1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pde6cQ91ZQ1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pde6cQ91ZQ1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pde6cQ91ZQ1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pde6cQ91ZQ1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pde6cQ91ZQ1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pde6cQ91ZQ1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pde6cQ91ZQ1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pde6cQ91ZQ1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pde6cQ91ZQ1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pde6cQ91ZQ1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pde6cQ91ZQ1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pde6cQ91ZQ1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pde6cQ91ZQ1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pde6cQ91ZQ1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pde6cQ91ZQ1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Pde6cQ91ZQ1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pde6cQ91ZQ1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pde6cQ91ZQ1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Pde6cQ91ZQ1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pde6cQ91ZQ1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pde6cQ91ZQ1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pde6cQ91ZQ1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde6cQ91ZQ1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde6cQ91ZQ1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde6cQ91ZQ1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde6cQ91ZQ1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pde6cQ91ZQ1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pde6cQ91ZQ1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pde6cQ91ZQ1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pde6cQ91ZQ1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pde6cQ91ZQ1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pde6cQ91ZQ1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pde6cQ91ZQ1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pde6cQ91ZQ1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pde6cQ91ZQ1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Pde6cQ91ZQ1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Pde6cQ91ZQ1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pde6cQ91ZQ1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pde6cQ91ZQ1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pde6cQ91ZQ1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pde6cQ91ZQ1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pde6cQ91ZQ1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pde6cQ91ZQ1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pde6cQ91ZQ1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pde6cQ91ZQ1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pde6cQ91ZQ1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pde6cQ91ZQ1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pde6cQ91ZQ1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pde6cQ91ZQ1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pde6cQ91ZQ1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pde6cQ91ZQ1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Pde6cQ91ZQ1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Pde6cQ91ZQ1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pde6cQ91ZQ1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pde6cQ91ZQ1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pde6cQ91ZQ1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pde6cQ91ZQ1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Pde6cQ91ZQ1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
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