Protein–RNA interactions for Protein: Q91XT4

Sec16b, Protein transport protein Sec16B, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16bQ91XT4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sec16bQ91XT4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sec16bQ91XT4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sec16bQ91XT4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sec16bQ91XT4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sec16bQ91XT4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sec16bQ91XT4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sec16bQ91XT4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sec16bQ91XT4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sec16bQ91XT4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sec16bQ91XT4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sec16bQ91XT4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Sec16bQ91XT4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Sec16bQ91XT4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sec16bQ91XT4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sec16bQ91XT4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sec16bQ91XT4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sec16bQ91XT4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sec16bQ91XT4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sec16bQ91XT4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sec16bQ91XT4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sec16bQ91XT4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sec16bQ91XT4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sec16bQ91XT4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sec16bQ91XT4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sec16bQ91XT4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sec16bQ91XT4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sec16bQ91XT4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sec16bQ91XT4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sec16bQ91XT4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sec16bQ91XT4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Sec16bQ91XT4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sec16bQ91XT4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sec16bQ91XT4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sec16bQ91XT4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sec16bQ91XT4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sec16bQ91XT4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sec16bQ91XT4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sec16bQ91XT4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sec16bQ91XT4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sec16bQ91XT4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sec16bQ91XT4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sec16bQ91XT4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sec16bQ91XT4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sec16bQ91XT4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sec16bQ91XT4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sec16bQ91XT4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sec16bQ91XT4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sec16bQ91XT4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sec16bQ91XT4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sec16bQ91XT4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sec16bQ91XT4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sec16bQ91XT4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Sec16bQ91XT4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sec16bQ91XT4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sec16bQ91XT4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sec16bQ91XT4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sec16bQ91XT4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sec16bQ91XT4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sec16bQ91XT4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sec16bQ91XT4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sec16bQ91XT4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sec16bQ91XT4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sec16bQ91XT4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sec16bQ91XT4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sec16bQ91XT4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sec16bQ91XT4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sec16bQ91XT4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sec16bQ91XT4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Sec16bQ91XT4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sec16bQ91XT4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sec16bQ91XT4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sec16bQ91XT4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sec16bQ91XT4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sec16bQ91XT4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sec16bQ91XT4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sec16bQ91XT4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sec16bQ91XT4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sec16bQ91XT4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sec16bQ91XT4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sec16bQ91XT4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sec16bQ91XT4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sec16bQ91XT4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sec16bQ91XT4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sec16bQ91XT4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sec16bQ91XT4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sec16bQ91XT4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Sec16bQ91XT4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sec16bQ91XT4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sec16bQ91XT4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sec16bQ91XT4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sec16bQ91XT4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sec16bQ91XT4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sec16bQ91XT4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sec16bQ91XT4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Sec16bQ91XT4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sec16bQ91XT4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sec16bQ91XT4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sec16bQ91XT4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sec16bQ91XT4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms