Protein–RNA interactions for Protein: Q91X17

Umod, Uromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UmodQ91X17 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UmodQ91X17 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UmodQ91X17 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UmodQ91X17 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UmodQ91X17 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UmodQ91X17 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UmodQ91X17 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UmodQ91X17 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UmodQ91X17 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UmodQ91X17 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UmodQ91X17 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UmodQ91X17 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UmodQ91X17 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UmodQ91X17 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UmodQ91X17 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UmodQ91X17 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UmodQ91X17 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UmodQ91X17 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UmodQ91X17 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UmodQ91X17 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UmodQ91X17 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UmodQ91X17 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UmodQ91X17 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UmodQ91X17 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UmodQ91X17 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UmodQ91X17 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UmodQ91X17 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UmodQ91X17 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UmodQ91X17 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UmodQ91X17 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UmodQ91X17 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UmodQ91X17 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UmodQ91X17 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UmodQ91X17 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UmodQ91X17 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UmodQ91X17 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UmodQ91X17 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UmodQ91X17 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UmodQ91X17 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UmodQ91X17 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UmodQ91X17 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UmodQ91X17 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UmodQ91X17 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UmodQ91X17 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UmodQ91X17 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UmodQ91X17 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UmodQ91X17 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UmodQ91X17 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UmodQ91X17 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UmodQ91X17 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UmodQ91X17 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UmodQ91X17 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UmodQ91X17 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UmodQ91X17 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UmodQ91X17 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UmodQ91X17 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UmodQ91X17 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UmodQ91X17 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UmodQ91X17 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UmodQ91X17 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UmodQ91X17 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UmodQ91X17 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UmodQ91X17 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UmodQ91X17 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UmodQ91X17 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UmodQ91X17 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UmodQ91X17 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UmodQ91X17 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UmodQ91X17 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UmodQ91X17 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UmodQ91X17 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UmodQ91X17 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UmodQ91X17 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UmodQ91X17 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UmodQ91X17 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UmodQ91X17 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UmodQ91X17 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UmodQ91X17 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UmodQ91X17 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UmodQ91X17 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UmodQ91X17 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UmodQ91X17 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UmodQ91X17 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UmodQ91X17 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UmodQ91X17 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UmodQ91X17 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UmodQ91X17 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UmodQ91X17 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UmodQ91X17 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UmodQ91X17 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UmodQ91X17 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UmodQ91X17 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UmodQ91X17 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UmodQ91X17 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UmodQ91X17 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UmodQ91X17 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UmodQ91X17 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UmodQ91X17 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UmodQ91X17 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UmodQ91X17 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms