Protein–RNA interactions for Protein: Q91VY6

Cytip, Cytohesin-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CytipQ91VY6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CytipQ91VY6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CytipQ91VY6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CytipQ91VY6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CytipQ91VY6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CytipQ91VY6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CytipQ91VY6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CytipQ91VY6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CytipQ91VY6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CytipQ91VY6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CytipQ91VY6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CytipQ91VY6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CytipQ91VY6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CytipQ91VY6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CytipQ91VY6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CytipQ91VY6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CytipQ91VY6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CytipQ91VY6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CytipQ91VY6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CytipQ91VY6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CytipQ91VY6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CytipQ91VY6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CytipQ91VY6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CytipQ91VY6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CytipQ91VY6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CytipQ91VY6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CytipQ91VY6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CytipQ91VY6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CytipQ91VY6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CytipQ91VY6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CytipQ91VY6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CytipQ91VY6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CytipQ91VY6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CytipQ91VY6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CytipQ91VY6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CytipQ91VY6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CytipQ91VY6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CytipQ91VY6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CytipQ91VY6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CytipQ91VY6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CytipQ91VY6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CytipQ91VY6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CytipQ91VY6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CytipQ91VY6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CytipQ91VY6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CytipQ91VY6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CytipQ91VY6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CytipQ91VY6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CytipQ91VY6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CytipQ91VY6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CytipQ91VY6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CytipQ91VY6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CytipQ91VY6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CytipQ91VY6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CytipQ91VY6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CytipQ91VY6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CytipQ91VY6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CytipQ91VY6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CytipQ91VY6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CytipQ91VY6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CytipQ91VY6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CytipQ91VY6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CytipQ91VY6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CytipQ91VY6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CytipQ91VY6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CytipQ91VY6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CytipQ91VY6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CytipQ91VY6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CytipQ91VY6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CytipQ91VY6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CytipQ91VY6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CytipQ91VY6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CytipQ91VY6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CytipQ91VY6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CytipQ91VY6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CytipQ91VY6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CytipQ91VY6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CytipQ91VY6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CytipQ91VY6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CytipQ91VY6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CytipQ91VY6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CytipQ91VY6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CytipQ91VY6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CytipQ91VY6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CytipQ91VY6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CytipQ91VY6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CytipQ91VY6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CytipQ91VY6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CytipQ91VY6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CytipQ91VY6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CytipQ91VY6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CytipQ91VY6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CytipQ91VY6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CytipQ91VY6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CytipQ91VY6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CytipQ91VY6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CytipQ91VY6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CytipQ91VY6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CytipQ91VY6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CytipQ91VY6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms