Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cacng5Q8VHW4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacng5Q8VHW4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacng5Q8VHW4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacng5Q8VHW4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacng5Q8VHW4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacng5Q8VHW4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacng5Q8VHW4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacng5Q8VHW4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacng5Q8VHW4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacng5Q8VHW4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacng5Q8VHW4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacng5Q8VHW4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacng5Q8VHW4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacng5Q8VHW4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacng5Q8VHW4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacng5Q8VHW4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacng5Q8VHW4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacng5Q8VHW4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacng5Q8VHW4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacng5Q8VHW4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacng5Q8VHW4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacng5Q8VHW4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacng5Q8VHW4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacng5Q8VHW4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacng5Q8VHW4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacng5Q8VHW4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacng5Q8VHW4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacng5Q8VHW4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacng5Q8VHW4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacng5Q8VHW4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacng5Q8VHW4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacng5Q8VHW4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacng5Q8VHW4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacng5Q8VHW4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacng5Q8VHW4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacng5Q8VHW4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacng5Q8VHW4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacng5Q8VHW4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacng5Q8VHW4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacng5Q8VHW4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacng5Q8VHW4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacng5Q8VHW4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacng5Q8VHW4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacng5Q8VHW4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacng5Q8VHW4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacng5Q8VHW4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacng5Q8VHW4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacng5Q8VHW4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacng5Q8VHW4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacng5Q8VHW4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacng5Q8VHW4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacng5Q8VHW4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacng5Q8VHW4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacng5Q8VHW4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacng5Q8VHW4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacng5Q8VHW4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacng5Q8VHW4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacng5Q8VHW4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacng5Q8VHW4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacng5Q8VHW4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacng5Q8VHW4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacng5Q8VHW4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacng5Q8VHW4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacng5Q8VHW4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacng5Q8VHW4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacng5Q8VHW4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacng5Q8VHW4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacng5Q8VHW4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacng5Q8VHW4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacng5Q8VHW4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacng5Q8VHW4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacng5Q8VHW4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacng5Q8VHW4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacng5Q8VHW4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacng5Q8VHW4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacng5Q8VHW4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacng5Q8VHW4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacng5Q8VHW4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacng5Q8VHW4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacng5Q8VHW4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacng5Q8VHW4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacng5Q8VHW4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacng5Q8VHW4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacng5Q8VHW4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacng5Q8VHW4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacng5Q8VHW4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacng5Q8VHW4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacng5Q8VHW4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacng5Q8VHW4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacng5Q8VHW4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacng5Q8VHW4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacng5Q8VHW4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacng5Q8VHW4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacng5Q8VHW4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacng5Q8VHW4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacng5Q8VHW4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacng5Q8VHW4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacng5Q8VHW4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacng5Q8VHW4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms