Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE4

Rpa1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa1Q8VEE4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rpa1Q8VEE4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpa1Q8VEE4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpa1Q8VEE4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rpa1Q8VEE4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rpa1Q8VEE4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rpa1Q8VEE4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rpa1Q8VEE4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rpa1Q8VEE4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rpa1Q8VEE4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpa1Q8VEE4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpa1Q8VEE4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rpa1Q8VEE4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rpa1Q8VEE4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rpa1Q8VEE4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rpa1Q8VEE4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rpa1Q8VEE4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rpa1Q8VEE4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpa1Q8VEE4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpa1Q8VEE4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpa1Q8VEE4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpa1Q8VEE4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpa1Q8VEE4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpa1Q8VEE4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpa1Q8VEE4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rpa1Q8VEE4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpa1Q8VEE4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpa1Q8VEE4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rpa1Q8VEE4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rpa1Q8VEE4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpa1Q8VEE4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpa1Q8VEE4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpa1Q8VEE4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpa1Q8VEE4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpa1Q8VEE4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpa1Q8VEE4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpa1Q8VEE4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpa1Q8VEE4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpa1Q8VEE4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpa1Q8VEE4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpa1Q8VEE4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpa1Q8VEE4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpa1Q8VEE4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpa1Q8VEE4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rpa1Q8VEE4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpa1Q8VEE4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpa1Q8VEE4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpa1Q8VEE4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpa1Q8VEE4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpa1Q8VEE4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpa1Q8VEE4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpa1Q8VEE4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpa1Q8VEE4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpa1Q8VEE4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rpa1Q8VEE4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rpa1Q8VEE4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rpa1Q8VEE4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rpa1Q8VEE4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rpa1Q8VEE4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rpa1Q8VEE4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rpa1Q8VEE4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rpa1Q8VEE4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpa1Q8VEE4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rpa1Q8VEE4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rpa1Q8VEE4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rpa1Q8VEE4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rpa1Q8VEE4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpa1Q8VEE4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rpa1Q8VEE4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rpa1Q8VEE4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpa1Q8VEE4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rpa1Q8VEE4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rpa1Q8VEE4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpa1Q8VEE4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpa1Q8VEE4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpa1Q8VEE4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpa1Q8VEE4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Rpa1Q8VEE4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rpa1Q8VEE4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpa1Q8VEE4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpa1Q8VEE4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpa1Q8VEE4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpa1Q8VEE4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rpa1Q8VEE4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rpa1Q8VEE4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpa1Q8VEE4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpa1Q8VEE4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpa1Q8VEE4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpa1Q8VEE4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpa1Q8VEE4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rpa1Q8VEE4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rpa1Q8VEE4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rpa1Q8VEE4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rpa1Q8VEE4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rpa1Q8VEE4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rpa1Q8VEE4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rpa1Q8VEE4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rpa1Q8VEE4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpa1Q8VEE4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpa1Q8VEE4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms