Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stx18Q8VDS8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stx18Q8VDS8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stx18Q8VDS8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stx18Q8VDS8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Stx18Q8VDS8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stx18Q8VDS8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stx18Q8VDS8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Stx18Q8VDS8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Stx18Q8VDS8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stx18Q8VDS8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stx18Q8VDS8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stx18Q8VDS8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stx18Q8VDS8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stx18Q8VDS8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stx18Q8VDS8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Stx18Q8VDS8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stx18Q8VDS8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Stx18Q8VDS8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stx18Q8VDS8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stx18Q8VDS8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stx18Q8VDS8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stx18Q8VDS8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stx18Q8VDS8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stx18Q8VDS8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Stx18Q8VDS8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stx18Q8VDS8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stx18Q8VDS8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Stx18Q8VDS8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stx18Q8VDS8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Stx18Q8VDS8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Stx18Q8VDS8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Stx18Q8VDS8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stx18Q8VDS8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Stx18Q8VDS8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stx18Q8VDS8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Stx18Q8VDS8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stx18Q8VDS8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stx18Q8VDS8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx18Q8VDS8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx18Q8VDS8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Stx18Q8VDS8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stx18Q8VDS8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stx18Q8VDS8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stx18Q8VDS8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Stx18Q8VDS8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stx18Q8VDS8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stx18Q8VDS8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stx18Q8VDS8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stx18Q8VDS8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stx18Q8VDS8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stx18Q8VDS8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Stx18Q8VDS8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Stx18Q8VDS8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stx18Q8VDS8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stx18Q8VDS8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stx18Q8VDS8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stx18Q8VDS8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Stx18Q8VDS8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stx18Q8VDS8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stx18Q8VDS8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stx18Q8VDS8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stx18Q8VDS8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stx18Q8VDS8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stx18Q8VDS8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stx18Q8VDS8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Stx18Q8VDS8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stx18Q8VDS8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stx18Q8VDS8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stx18Q8VDS8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stx18Q8VDS8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Stx18Q8VDS8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stx18Q8VDS8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stx18Q8VDS8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stx18Q8VDS8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stx18Q8VDS8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Stx18Q8VDS8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stx18Q8VDS8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stx18Q8VDS8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stx18Q8VDS8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stx18Q8VDS8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stx18Q8VDS8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stx18Q8VDS8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stx18Q8VDS8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx18Q8VDS8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx18Q8VDS8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx18Q8VDS8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx18Q8VDS8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx18Q8VDS8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stx18Q8VDS8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stx18Q8VDS8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Stx18Q8VDS8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stx18Q8VDS8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stx18Q8VDS8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stx18Q8VDS8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stx18Q8VDS8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stx18Q8VDS8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stx18Q8VDS8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stx18Q8VDS8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stx18Q8VDS8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms