Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TgdsQ8VDR7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TgdsQ8VDR7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TgdsQ8VDR7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TgdsQ8VDR7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TgdsQ8VDR7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TgdsQ8VDR7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TgdsQ8VDR7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TgdsQ8VDR7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TgdsQ8VDR7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TgdsQ8VDR7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TgdsQ8VDR7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TgdsQ8VDR7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TgdsQ8VDR7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TgdsQ8VDR7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TgdsQ8VDR7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TgdsQ8VDR7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TgdsQ8VDR7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TgdsQ8VDR7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TgdsQ8VDR7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TgdsQ8VDR7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TgdsQ8VDR7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TgdsQ8VDR7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TgdsQ8VDR7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TgdsQ8VDR7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TgdsQ8VDR7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TgdsQ8VDR7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TgdsQ8VDR7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TgdsQ8VDR7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TgdsQ8VDR7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TgdsQ8VDR7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TgdsQ8VDR7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TgdsQ8VDR7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TgdsQ8VDR7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TgdsQ8VDR7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TgdsQ8VDR7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TgdsQ8VDR7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TgdsQ8VDR7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TgdsQ8VDR7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TgdsQ8VDR7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TgdsQ8VDR7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TgdsQ8VDR7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TgdsQ8VDR7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TgdsQ8VDR7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TgdsQ8VDR7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TgdsQ8VDR7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TgdsQ8VDR7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TgdsQ8VDR7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TgdsQ8VDR7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TgdsQ8VDR7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TgdsQ8VDR7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TgdsQ8VDR7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TgdsQ8VDR7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TgdsQ8VDR7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TgdsQ8VDR7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TgdsQ8VDR7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TgdsQ8VDR7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TgdsQ8VDR7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TgdsQ8VDR7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TgdsQ8VDR7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TgdsQ8VDR7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TgdsQ8VDR7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TgdsQ8VDR7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TgdsQ8VDR7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TgdsQ8VDR7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TgdsQ8VDR7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TgdsQ8VDR7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TgdsQ8VDR7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TgdsQ8VDR7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TgdsQ8VDR7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TgdsQ8VDR7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TgdsQ8VDR7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TgdsQ8VDR7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TgdsQ8VDR7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TgdsQ8VDR7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TgdsQ8VDR7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TgdsQ8VDR7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TgdsQ8VDR7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TgdsQ8VDR7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TgdsQ8VDR7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TgdsQ8VDR7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TgdsQ8VDR7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TgdsQ8VDR7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TgdsQ8VDR7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TgdsQ8VDR7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TgdsQ8VDR7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TgdsQ8VDR7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TgdsQ8VDR7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TgdsQ8VDR7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TgdsQ8VDR7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TgdsQ8VDR7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TgdsQ8VDR7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TgdsQ8VDR7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TgdsQ8VDR7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TgdsQ8VDR7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TgdsQ8VDR7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TgdsQ8VDR7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TgdsQ8VDR7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TgdsQ8VDR7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TgdsQ8VDR7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms