Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ubxn4Q8VCH8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ubxn4Q8VCH8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ubxn4Q8VCH8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ubxn4Q8VCH8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ubxn4Q8VCH8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Ubxn4Q8VCH8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ubxn4Q8VCH8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ubxn4Q8VCH8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ubxn4Q8VCH8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ubxn4Q8VCH8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ubxn4Q8VCH8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Ubxn4Q8VCH8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ubxn4Q8VCH8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ubxn4Q8VCH8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ubxn4Q8VCH8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ubxn4Q8VCH8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ubxn4Q8VCH8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ubxn4Q8VCH8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ubxn4Q8VCH8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ubxn4Q8VCH8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ubxn4Q8VCH8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Ubxn4Q8VCH8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ubxn4Q8VCH8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ubxn4Q8VCH8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Ubxn4Q8VCH8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Ubxn4Q8VCH8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ubxn4Q8VCH8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ubxn4Q8VCH8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ubxn4Q8VCH8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ubxn4Q8VCH8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ubxn4Q8VCH8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ubxn4Q8VCH8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ubxn4Q8VCH8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ubxn4Q8VCH8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Ubxn4Q8VCH8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ubxn4Q8VCH8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Ubxn4Q8VCH8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ubxn4Q8VCH8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ubxn4Q8VCH8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ubxn4Q8VCH8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ubxn4Q8VCH8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ubxn4Q8VCH8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ubxn4Q8VCH8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ubxn4Q8VCH8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ubxn4Q8VCH8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ubxn4Q8VCH8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ubxn4Q8VCH8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ubxn4Q8VCH8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Ubxn4Q8VCH8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Ubxn4Q8VCH8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ubxn4Q8VCH8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ubxn4Q8VCH8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ubxn4Q8VCH8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ubxn4Q8VCH8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ubxn4Q8VCH8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ubxn4Q8VCH8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ubxn4Q8VCH8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ubxn4Q8VCH8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ubxn4Q8VCH8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Ubxn4Q8VCH8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ubxn4Q8VCH8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ubxn4Q8VCH8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ubxn4Q8VCH8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ubxn4Q8VCH8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ubxn4Q8VCH8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ubxn4Q8VCH8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ubxn4Q8VCH8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ubxn4Q8VCH8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ubxn4Q8VCH8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ubxn4Q8VCH8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ubxn4Q8VCH8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ubxn4Q8VCH8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ubxn4Q8VCH8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Ubxn4Q8VCH8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ubxn4Q8VCH8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ubxn4Q8VCH8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ubxn4Q8VCH8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ubxn4Q8VCH8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ubxn4Q8VCH8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ubxn4Q8VCH8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ubxn4Q8VCH8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ubxn4Q8VCH8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ubxn4Q8VCH8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ubxn4Q8VCH8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ubxn4Q8VCH8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubxn4Q8VCH8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubxn4Q8VCH8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ubxn4Q8VCH8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ubxn4Q8VCH8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
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