Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC6

Ccm2l, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2lQ8VCC6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccm2lQ8VCC6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccm2lQ8VCC6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccm2lQ8VCC6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccm2lQ8VCC6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccm2lQ8VCC6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccm2lQ8VCC6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccm2lQ8VCC6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccm2lQ8VCC6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccm2lQ8VCC6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccm2lQ8VCC6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccm2lQ8VCC6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccm2lQ8VCC6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccm2lQ8VCC6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccm2lQ8VCC6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccm2lQ8VCC6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccm2lQ8VCC6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccm2lQ8VCC6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccm2lQ8VCC6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccm2lQ8VCC6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccm2lQ8VCC6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccm2lQ8VCC6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccm2lQ8VCC6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccm2lQ8VCC6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccm2lQ8VCC6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccm2lQ8VCC6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccm2lQ8VCC6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccm2lQ8VCC6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccm2lQ8VCC6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccm2lQ8VCC6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccm2lQ8VCC6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccm2lQ8VCC6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccm2lQ8VCC6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccm2lQ8VCC6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccm2lQ8VCC6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccm2lQ8VCC6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccm2lQ8VCC6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccm2lQ8VCC6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccm2lQ8VCC6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccm2lQ8VCC6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccm2lQ8VCC6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccm2lQ8VCC6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccm2lQ8VCC6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccm2lQ8VCC6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccm2lQ8VCC6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccm2lQ8VCC6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccm2lQ8VCC6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccm2lQ8VCC6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccm2lQ8VCC6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccm2lQ8VCC6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccm2lQ8VCC6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccm2lQ8VCC6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccm2lQ8VCC6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccm2lQ8VCC6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccm2lQ8VCC6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccm2lQ8VCC6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccm2lQ8VCC6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccm2lQ8VCC6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccm2lQ8VCC6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccm2lQ8VCC6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccm2lQ8VCC6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccm2lQ8VCC6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccm2lQ8VCC6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccm2lQ8VCC6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccm2lQ8VCC6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccm2lQ8VCC6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccm2lQ8VCC6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccm2lQ8VCC6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccm2lQ8VCC6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccm2lQ8VCC6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccm2lQ8VCC6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccm2lQ8VCC6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccm2lQ8VCC6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccm2lQ8VCC6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccm2lQ8VCC6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccm2lQ8VCC6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccm2lQ8VCC6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccm2lQ8VCC6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccm2lQ8VCC6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccm2lQ8VCC6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccm2lQ8VCC6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccm2lQ8VCC6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccm2lQ8VCC6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccm2lQ8VCC6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccm2lQ8VCC6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccm2lQ8VCC6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccm2lQ8VCC6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccm2lQ8VCC6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccm2lQ8VCC6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccm2lQ8VCC6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccm2lQ8VCC6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccm2lQ8VCC6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccm2lQ8VCC6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccm2lQ8VCC6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccm2lQ8VCC6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccm2lQ8VCC6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccm2lQ8VCC6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccm2lQ8VCC6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccm2lQ8VCC6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccm2lQ8VCC6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms