Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4T3

Stradb, STE20-related kinase adapter protein beta, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StradbQ8K4T3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
StradbQ8K4T3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
StradbQ8K4T3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
StradbQ8K4T3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
StradbQ8K4T3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
StradbQ8K4T3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
StradbQ8K4T3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
StradbQ8K4T3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
StradbQ8K4T3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
StradbQ8K4T3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
StradbQ8K4T3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
StradbQ8K4T3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
StradbQ8K4T3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
StradbQ8K4T3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
StradbQ8K4T3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
StradbQ8K4T3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
StradbQ8K4T3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
StradbQ8K4T3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
StradbQ8K4T3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
StradbQ8K4T3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
StradbQ8K4T3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
StradbQ8K4T3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
StradbQ8K4T3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
StradbQ8K4T3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
StradbQ8K4T3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
StradbQ8K4T3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
StradbQ8K4T3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
StradbQ8K4T3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
StradbQ8K4T3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
StradbQ8K4T3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
StradbQ8K4T3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
StradbQ8K4T3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
StradbQ8K4T3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
StradbQ8K4T3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
StradbQ8K4T3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
StradbQ8K4T3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
StradbQ8K4T3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
StradbQ8K4T3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
StradbQ8K4T3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
StradbQ8K4T3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
StradbQ8K4T3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
StradbQ8K4T3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
StradbQ8K4T3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
StradbQ8K4T3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
StradbQ8K4T3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
StradbQ8K4T3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
StradbQ8K4T3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
StradbQ8K4T3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
StradbQ8K4T3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
StradbQ8K4T3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
StradbQ8K4T3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
StradbQ8K4T3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
StradbQ8K4T3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
StradbQ8K4T3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
StradbQ8K4T3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
StradbQ8K4T3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
StradbQ8K4T3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
StradbQ8K4T3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
StradbQ8K4T3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
StradbQ8K4T3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
StradbQ8K4T3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
StradbQ8K4T3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
StradbQ8K4T3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
StradbQ8K4T3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
StradbQ8K4T3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
StradbQ8K4T3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
StradbQ8K4T3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
StradbQ8K4T3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
StradbQ8K4T3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
StradbQ8K4T3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
StradbQ8K4T3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
StradbQ8K4T3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
StradbQ8K4T3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
StradbQ8K4T3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
StradbQ8K4T3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
StradbQ8K4T3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
StradbQ8K4T3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
StradbQ8K4T3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
StradbQ8K4T3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
StradbQ8K4T3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
StradbQ8K4T3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
StradbQ8K4T3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
StradbQ8K4T3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
StradbQ8K4T3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
StradbQ8K4T3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
StradbQ8K4T3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
StradbQ8K4T3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
StradbQ8K4T3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
StradbQ8K4T3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
StradbQ8K4T3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
StradbQ8K4T3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
StradbQ8K4T3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
StradbQ8K4T3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
StradbQ8K4T3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
StradbQ8K4T3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
StradbQ8K4T3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
StradbQ8K4T3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
StradbQ8K4T3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
StradbQ8K4T3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
StradbQ8K4T3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms