Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4S1

Plce1, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase epsilon-1, mousemouse

Predictions only

Length 2,282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plce1Q8K4S1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Plce1Q8K4S1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Plce1Q8K4S1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Plce1Q8K4S1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Plce1Q8K4S1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Plce1Q8K4S1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plce1Q8K4S1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plce1Q8K4S1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Plce1Q8K4S1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Plce1Q8K4S1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Plce1Q8K4S1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Plce1Q8K4S1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Plce1Q8K4S1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Plce1Q8K4S1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Plce1Q8K4S1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Plce1Q8K4S1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Plce1Q8K4S1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Plce1Q8K4S1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Plce1Q8K4S1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plce1Q8K4S1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Plce1Q8K4S1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Plce1Q8K4S1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Plce1Q8K4S1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Plce1Q8K4S1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Plce1Q8K4S1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Plce1Q8K4S1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Plce1Q8K4S1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Plce1Q8K4S1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Plce1Q8K4S1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Plce1Q8K4S1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Plce1Q8K4S1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Plce1Q8K4S1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Plce1Q8K4S1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Plce1Q8K4S1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Plce1Q8K4S1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Plce1Q8K4S1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Plce1Q8K4S1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Plce1Q8K4S1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Plce1Q8K4S1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Plce1Q8K4S1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Plce1Q8K4S1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Plce1Q8K4S1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Plce1Q8K4S1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Plce1Q8K4S1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Plce1Q8K4S1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Plce1Q8K4S1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plce1Q8K4S1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plce1Q8K4S1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plce1Q8K4S1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Plce1Q8K4S1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Plce1Q8K4S1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Plce1Q8K4S1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Plce1Q8K4S1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Plce1Q8K4S1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Plce1Q8K4S1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Plce1Q8K4S1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Plce1Q8K4S1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Plce1Q8K4S1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Plce1Q8K4S1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Plce1Q8K4S1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Plce1Q8K4S1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Plce1Q8K4S1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Plce1Q8K4S1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Plce1Q8K4S1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Plce1Q8K4S1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Plce1Q8K4S1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Plce1Q8K4S1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Plce1Q8K4S1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Plce1Q8K4S1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Plce1Q8K4S1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Plce1Q8K4S1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Plce1Q8K4S1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Plce1Q8K4S1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Plce1Q8K4S1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Plce1Q8K4S1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Plce1Q8K4S1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Plce1Q8K4S1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Plce1Q8K4S1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Plce1Q8K4S1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Plce1Q8K4S1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Plce1Q8K4S1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Plce1Q8K4S1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Plce1Q8K4S1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Plce1Q8K4S1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Plce1Q8K4S1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Plce1Q8K4S1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Plce1Q8K4S1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Plce1Q8K4S1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Plce1Q8K4S1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Plce1Q8K4S1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Plce1Q8K4S1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Plce1Q8K4S1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Plce1Q8K4S1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Plce1Q8K4S1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Plce1Q8K4S1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Plce1Q8K4S1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Plce1Q8K4S1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Plce1Q8K4S1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Plce1Q8K4S1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Plce1Q8K4S1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms