Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r72Q8K3N7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r72Q8K3N7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r72Q8K3N7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r72Q8K3N7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r72Q8K3N7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r72Q8K3N7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r72Q8K3N7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r72Q8K3N7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r72Q8K3N7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r72Q8K3N7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vmn1r72Q8K3N7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r72Q8K3N7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r72Q8K3N7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r72Q8K3N7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r72Q8K3N7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r72Q8K3N7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r72Q8K3N7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r72Q8K3N7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r72Q8K3N7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r72Q8K3N7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r72Q8K3N7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r72Q8K3N7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r72Q8K3N7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r72Q8K3N7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r72Q8K3N7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r72Q8K3N7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r72Q8K3N7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r72Q8K3N7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r72Q8K3N7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r72Q8K3N7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r72Q8K3N7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r72Q8K3N7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r72Q8K3N7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r72Q8K3N7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r72Q8K3N7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r72Q8K3N7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn1r72Q8K3N7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r72Q8K3N7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r72Q8K3N7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r72Q8K3N7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r72Q8K3N7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r72Q8K3N7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r72Q8K3N7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r72Q8K3N7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r72Q8K3N7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r72Q8K3N7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r72Q8K3N7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r72Q8K3N7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r72Q8K3N7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r72Q8K3N7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r72Q8K3N7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r72Q8K3N7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r72Q8K3N7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r72Q8K3N7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r72Q8K3N7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r72Q8K3N7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r72Q8K3N7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r72Q8K3N7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r72Q8K3N7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r72Q8K3N7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r72Q8K3N7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r72Q8K3N7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r72Q8K3N7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r72Q8K3N7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r72Q8K3N7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r72Q8K3N7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r72Q8K3N7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r72Q8K3N7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r72Q8K3N7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r72Q8K3N7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r72Q8K3N7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r72Q8K3N7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r72Q8K3N7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r72Q8K3N7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r72Q8K3N7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r72Q8K3N7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r72Q8K3N7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r72Q8K3N7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r72Q8K3N7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r72Q8K3N7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r72Q8K3N7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r72Q8K3N7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r72Q8K3N7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r72Q8K3N7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r72Q8K3N7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r72Q8K3N7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r72Q8K3N7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r72Q8K3N7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r72Q8K3N7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r72Q8K3N7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r72Q8K3N7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r72Q8K3N7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r72Q8K3N7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r72Q8K3N7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn1r72Q8K3N7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms