Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A0

Hscb, Iron-sulfur cluster co-chaperone protein HscB, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HscbQ8K3A0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HscbQ8K3A0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HscbQ8K3A0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HscbQ8K3A0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HscbQ8K3A0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HscbQ8K3A0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HscbQ8K3A0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HscbQ8K3A0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HscbQ8K3A0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HscbQ8K3A0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HscbQ8K3A0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HscbQ8K3A0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HscbQ8K3A0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HscbQ8K3A0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HscbQ8K3A0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HscbQ8K3A0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HscbQ8K3A0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HscbQ8K3A0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HscbQ8K3A0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HscbQ8K3A0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HscbQ8K3A0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HscbQ8K3A0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HscbQ8K3A0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HscbQ8K3A0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HscbQ8K3A0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HscbQ8K3A0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HscbQ8K3A0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HscbQ8K3A0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HscbQ8K3A0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HscbQ8K3A0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HscbQ8K3A0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HscbQ8K3A0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HscbQ8K3A0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HscbQ8K3A0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HscbQ8K3A0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HscbQ8K3A0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HscbQ8K3A0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HscbQ8K3A0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HscbQ8K3A0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HscbQ8K3A0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HscbQ8K3A0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HscbQ8K3A0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HscbQ8K3A0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HscbQ8K3A0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HscbQ8K3A0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HscbQ8K3A0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HscbQ8K3A0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HscbQ8K3A0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HscbQ8K3A0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HscbQ8K3A0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HscbQ8K3A0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HscbQ8K3A0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HscbQ8K3A0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HscbQ8K3A0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HscbQ8K3A0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HscbQ8K3A0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HscbQ8K3A0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HscbQ8K3A0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HscbQ8K3A0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HscbQ8K3A0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HscbQ8K3A0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HscbQ8K3A0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HscbQ8K3A0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HscbQ8K3A0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HscbQ8K3A0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HscbQ8K3A0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HscbQ8K3A0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HscbQ8K3A0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HscbQ8K3A0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HscbQ8K3A0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HscbQ8K3A0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HscbQ8K3A0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HscbQ8K3A0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HscbQ8K3A0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HscbQ8K3A0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HscbQ8K3A0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HscbQ8K3A0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HscbQ8K3A0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HscbQ8K3A0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HscbQ8K3A0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HscbQ8K3A0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HscbQ8K3A0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HscbQ8K3A0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HscbQ8K3A0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HscbQ8K3A0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HscbQ8K3A0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HscbQ8K3A0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HscbQ8K3A0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HscbQ8K3A0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HscbQ8K3A0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HscbQ8K3A0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HscbQ8K3A0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HscbQ8K3A0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HscbQ8K3A0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HscbQ8K3A0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HscbQ8K3A0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HscbQ8K3A0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HscbQ8K3A0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HscbQ8K3A0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HscbQ8K3A0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms