Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sash3Q8K352 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sash3Q8K352 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sash3Q8K352 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sash3Q8K352 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sash3Q8K352 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sash3Q8K352 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sash3Q8K352 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sash3Q8K352 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sash3Q8K352 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sash3Q8K352 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sash3Q8K352 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Sash3Q8K352 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sash3Q8K352 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sash3Q8K352 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sash3Q8K352 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sash3Q8K352 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Sash3Q8K352 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Sash3Q8K352 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sash3Q8K352 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sash3Q8K352 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sash3Q8K352 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sash3Q8K352 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sash3Q8K352 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sash3Q8K352 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Sash3Q8K352 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Sash3Q8K352 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sash3Q8K352 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sash3Q8K352 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sash3Q8K352 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sash3Q8K352 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sash3Q8K352 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sash3Q8K352 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sash3Q8K352 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sash3Q8K352 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sash3Q8K352 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sash3Q8K352 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sash3Q8K352 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Sash3Q8K352 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sash3Q8K352 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sash3Q8K352 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sash3Q8K352 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sash3Q8K352 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sash3Q8K352 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sash3Q8K352 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sash3Q8K352 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sash3Q8K352 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sash3Q8K352 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sash3Q8K352 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sash3Q8K352 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Sash3Q8K352 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sash3Q8K352 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sash3Q8K352 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sash3Q8K352 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Sash3Q8K352 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sash3Q8K352 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sash3Q8K352 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sash3Q8K352 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sash3Q8K352 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sash3Q8K352 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sash3Q8K352 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sash3Q8K352 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sash3Q8K352 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Sash3Q8K352 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sash3Q8K352 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sash3Q8K352 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sash3Q8K352 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sash3Q8K352 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sash3Q8K352 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sash3Q8K352 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sash3Q8K352 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sash3Q8K352 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sash3Q8K352 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sash3Q8K352 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sash3Q8K352 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sash3Q8K352 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sash3Q8K352 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sash3Q8K352 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sash3Q8K352 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sash3Q8K352 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sash3Q8K352 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sash3Q8K352 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Sash3Q8K352 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sash3Q8K352 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sash3Q8K352 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sash3Q8K352 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sash3Q8K352 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sash3Q8K352 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sash3Q8K352 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sash3Q8K352 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sash3Q8K352 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Sash3Q8K352 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sash3Q8K352 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sash3Q8K352 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sash3Q8K352 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Sash3Q8K352 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sash3Q8K352 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sash3Q8K352 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sash3Q8K352 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sash3Q8K352 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms