Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Shtn1Q8K2Q9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,58■■■□□ 2,97
Shtn1Q8K2Q9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Shtn1Q8K2Q9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,96
Shtn1Q8K2Q9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Shtn1Q8K2Q9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Shtn1Q8K2Q9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Shtn1Q8K2Q9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Shtn1Q8K2Q9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Shtn1Q8K2Q9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Shtn1Q8K2Q9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Shtn1Q8K2Q9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Shtn1Q8K2Q9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Shtn1Q8K2Q9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Shtn1Q8K2Q9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Shtn1Q8K2Q9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33,19■■■□□ 2,9
Shtn1Q8K2Q9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Shtn1Q8K2Q9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,16■■■□□ 2,9
Shtn1Q8K2Q9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Shtn1Q8K2Q9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Shtn1Q8K2Q9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Shtn1Q8K2Q9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33,09■■■□□ 2,89
Shtn1Q8K2Q9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Shtn1Q8K2Q9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33,04■■■□□ 2,88
Shtn1Q8K2Q9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,03■■■□□ 2,88
Shtn1Q8K2Q9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Shtn1Q8K2Q9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,87
Shtn1Q8K2Q9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,01■■■□□ 2,87
Shtn1Q8K2Q9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Shtn1Q8K2Q9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Shtn1Q8K2Q9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Shtn1Q8K2Q9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32,98■■■□□ 2,87
Shtn1Q8K2Q9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Shtn1Q8K2Q9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Shtn1Q8K2Q9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Shtn1Q8K2Q9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Shtn1Q8K2Q9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Shtn1Q8K2Q9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Shtn1Q8K2Q9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32,85■■■□□ 2,85
Shtn1Q8K2Q9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32,8■■■□□ 2,84
Shtn1Q8K2Q9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Shtn1Q8K2Q9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32,77■■■□□ 2,84
Shtn1Q8K2Q9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32,77■■■□□ 2,84
Shtn1Q8K2Q9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Shtn1Q8K2Q9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Shtn1Q8K2Q9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Shtn1Q8K2Q9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32,67■■■□□ 2,82
Shtn1Q8K2Q9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Shtn1Q8K2Q9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Shtn1Q8K2Q9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Shtn1Q8K2Q9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Shtn1Q8K2Q9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32,64■■■□□ 2,82
Shtn1Q8K2Q9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Shtn1Q8K2Q9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,63■■■□□ 2,81
Shtn1Q8K2Q9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Shtn1Q8K2Q9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Shtn1Q8K2Q9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Shtn1Q8K2Q9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Shtn1Q8K2Q9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,5■■■□□ 2,79
Shtn1Q8K2Q9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,78
Shtn1Q8K2Q9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Shtn1Q8K2Q9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Shtn1Q8K2Q9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Shtn1Q8K2Q9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Shtn1Q8K2Q9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,29■■■□□ 2,76
Shtn1Q8K2Q9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32,28■■■□□ 2,76
Shtn1Q8K2Q9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Shtn1Q8K2Q9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Shtn1Q8K2Q9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Shtn1Q8K2Q9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32,24■■■□□ 2,75
Shtn1Q8K2Q9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,23■■■□□ 2,75
Shtn1Q8K2Q9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC32,21■■■□□ 2,75
Shtn1Q8K2Q9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC32,2■■■□□ 2,75
Shtn1Q8K2Q9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,74
Shtn1Q8K2Q9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Shtn1Q8K2Q9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Shtn1Q8K2Q9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32,16■■■□□ 2,74
Shtn1Q8K2Q9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32,14■■■□□ 2,74
Shtn1Q8K2Q9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Shtn1Q8K2Q9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Shtn1Q8K2Q9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Shtn1Q8K2Q9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32,07■■■□□ 2,72
Shtn1Q8K2Q9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32,07■■■□□ 2,72
Shtn1Q8K2Q9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32,05■■■□□ 2,72
Shtn1Q8K2Q9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Shtn1Q8K2Q9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Shtn1Q8K2Q9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Shtn1Q8K2Q9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Shtn1Q8K2Q9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Shtn1Q8K2Q9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2,71
Shtn1Q8K2Q9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31,99■■■□□ 2,71
Shtn1Q8K2Q9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC31,97■■■□□ 2,71
Shtn1Q8K2Q9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Shtn1Q8K2Q9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Shtn1Q8K2Q9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31,96■■■□□ 2,71
Shtn1Q8K2Q9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Shtn1Q8K2Q9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC31,94■■■□□ 2,7
Shtn1Q8K2Q9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Shtn1Q8K2Q9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Shtn1Q8K2Q9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81,6 ms