Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q0

Commd9, COMM domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd9Q8K2Q0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21,85■■□□□ 1,09
Commd9Q8K2Q0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Commd9Q8K2Q0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21,84■■□□□ 1,09
Commd9Q8K2Q0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21,83■■□□□ 1,08
Commd9Q8K2Q0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Commd9Q8K2Q0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Commd9Q8K2Q0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21,8■■□□□ 1,08
Commd9Q8K2Q0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21,75■■□□□ 1,07
Commd9Q8K2Q0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Commd9Q8K2Q0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Commd9Q8K2Q0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Commd9Q8K2Q0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Commd9Q8K2Q0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Commd9Q8K2Q0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Commd9Q8K2Q0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Commd9Q8K2Q0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Commd9Q8K2Q0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21,63■■□□□ 1,05
Commd9Q8K2Q0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21,63■■□□□ 1,05
Commd9Q8K2Q0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Commd9Q8K2Q0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21,59■■□□□ 1,05
Commd9Q8K2Q0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Commd9Q8K2Q0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Commd9Q8K2Q0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Commd9Q8K2Q0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21,57■■□□□ 1,04
Commd9Q8K2Q0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Commd9Q8K2Q0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21,54■■□□□ 1,04
Commd9Q8K2Q0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Commd9Q8K2Q0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Commd9Q8K2Q0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Commd9Q8K2Q0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Commd9Q8K2Q0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Commd9Q8K2Q0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Commd9Q8K2Q0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Commd9Q8K2Q0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,47■■□□□ 1,03
Commd9Q8K2Q0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Commd9Q8K2Q0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,03
Commd9Q8K2Q0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21,45■■□□□ 1,02
Commd9Q8K2Q0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,45■■□□□ 1,02
Commd9Q8K2Q0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Commd9Q8K2Q0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,44■■□□□ 1,02
Commd9Q8K2Q0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21,44■■□□□ 1,02
Commd9Q8K2Q0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Commd9Q8K2Q0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21,4■■□□□ 1,02
Commd9Q8K2Q0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21,39■■□□□ 1,01
Commd9Q8K2Q0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Commd9Q8K2Q0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Commd9Q8K2Q0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21,34■■□□□ 1,01
Commd9Q8K2Q0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Commd9Q8K2Q0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Commd9Q8K2Q0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,33■■□□□ 1,01
Commd9Q8K2Q0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Commd9Q8K2Q0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,32■■□□□ 1
Commd9Q8K2Q0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Commd9Q8K2Q0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21,3■■□□□ 1
Commd9Q8K2Q0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21,29■■□□□ 1
Commd9Q8K2Q0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Commd9Q8K2Q0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,22■□□□□ 0,99
Commd9Q8K2Q0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Commd9Q8K2Q0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Commd9Q8K2Q0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21,18■□□□□ 0,98
Commd9Q8K2Q0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Commd9Q8K2Q0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Commd9Q8K2Q0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Commd9Q8K2Q0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21,17■□□□□ 0,98
Commd9Q8K2Q0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Commd9Q8K2Q0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Commd9Q8K2Q0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Commd9Q8K2Q0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,15■□□□□ 0,98
Commd9Q8K2Q0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Commd9Q8K2Q0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Commd9Q8K2Q0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Commd9Q8K2Q0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Commd9Q8K2Q0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Commd9Q8K2Q0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Commd9Q8K2Q0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Commd9Q8K2Q0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Commd9Q8K2Q0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21,07■□□□□ 0,96
Commd9Q8K2Q0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21,07■□□□□ 0,96
Commd9Q8K2Q0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Commd9Q8K2Q0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Commd9Q8K2Q0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Commd9Q8K2Q0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Commd9Q8K2Q0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Commd9Q8K2Q0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Commd9Q8K2Q0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Commd9Q8K2Q0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Commd9Q8K2Q0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Commd9Q8K2Q0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Commd9Q8K2Q0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20,92■□□□□ 0,94
Commd9Q8K2Q0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Commd9Q8K2Q0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Commd9Q8K2Q0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Commd9Q8K2Q0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Commd9Q8K2Q0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20,89■□□□□ 0,94
Commd9Q8K2Q0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Commd9Q8K2Q0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Commd9Q8K2Q0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Commd9Q8K2Q0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Commd9Q8K2Q0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Commd9Q8K2Q0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
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