Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2P6

Rfesd, Rieske domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfesdQ8K2P6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
RfesdQ8K2P6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
RfesdQ8K2P6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
RfesdQ8K2P6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
RfesdQ8K2P6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
RfesdQ8K2P6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
RfesdQ8K2P6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
RfesdQ8K2P6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
RfesdQ8K2P6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
RfesdQ8K2P6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
RfesdQ8K2P6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
RfesdQ8K2P6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
RfesdQ8K2P6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,1■■□□□ 1,61
RfesdQ8K2P6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,06■■□□□ 1,6
RfesdQ8K2P6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
RfesdQ8K2P6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
RfesdQ8K2P6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25,01■■□□□ 1,59
RfesdQ8K2P6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
RfesdQ8K2P6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
RfesdQ8K2P6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
RfesdQ8K2P6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
RfesdQ8K2P6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24,9■■□□□ 1,58
RfesdQ8K2P6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24,88■■□□□ 1,57
RfesdQ8K2P6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24,88■■□□□ 1,57
RfesdQ8K2P6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24,86■■□□□ 1,57
RfesdQ8K2P6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
RfesdQ8K2P6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
RfesdQ8K2P6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
RfesdQ8K2P6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
RfesdQ8K2P6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
RfesdQ8K2P6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
RfesdQ8K2P6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
RfesdQ8K2P6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
RfesdQ8K2P6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24,78■■□□□ 1,56
RfesdQ8K2P6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
RfesdQ8K2P6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
RfesdQ8K2P6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
RfesdQ8K2P6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24,75■■□□□ 1,55
RfesdQ8K2P6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
RfesdQ8K2P6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
RfesdQ8K2P6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
RfesdQ8K2P6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
RfesdQ8K2P6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
RfesdQ8K2P6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,68■■□□□ 1,54
RfesdQ8K2P6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
RfesdQ8K2P6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
RfesdQ8K2P6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
RfesdQ8K2P6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
RfesdQ8K2P6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
RfesdQ8K2P6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
RfesdQ8K2P6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24,55■■□□□ 1,52
RfesdQ8K2P6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
RfesdQ8K2P6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,52■■□□□ 1,52
RfesdQ8K2P6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
RfesdQ8K2P6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
RfesdQ8K2P6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
RfesdQ8K2P6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,5
RfesdQ8K2P6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
RfesdQ8K2P6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
RfesdQ8K2P6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
RfesdQ8K2P6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24,35■■□□□ 1,49
RfesdQ8K2P6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24,31■■□□□ 1,48
RfesdQ8K2P6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24,3■■□□□ 1,48
RfesdQ8K2P6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,29■■□□□ 1,48
RfesdQ8K2P6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
RfesdQ8K2P6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,27■■□□□ 1,48
RfesdQ8K2P6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,27■■□□□ 1,48
RfesdQ8K2P6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
RfesdQ8K2P6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24,25■■□□□ 1,47
RfesdQ8K2P6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
RfesdQ8K2P6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
RfesdQ8K2P6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
RfesdQ8K2P6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
RfesdQ8K2P6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
RfesdQ8K2P6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
RfesdQ8K2P6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
RfesdQ8K2P6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
RfesdQ8K2P6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24,16■■□□□ 1,46
RfesdQ8K2P6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,16■■□□□ 1,46
RfesdQ8K2P6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
RfesdQ8K2P6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24,11■■□□□ 1,45
RfesdQ8K2P6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
RfesdQ8K2P6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24,11■■□□□ 1,45
RfesdQ8K2P6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
RfesdQ8K2P6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24,1■■□□□ 1,45
RfesdQ8K2P6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
RfesdQ8K2P6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
RfesdQ8K2P6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
RfesdQ8K2P6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24,08■■□□□ 1,44
RfesdQ8K2P6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,44
RfesdQ8K2P6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,06■■□□□ 1,44
RfesdQ8K2P6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,05■■□□□ 1,44
RfesdQ8K2P6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24,05■■□□□ 1,44
RfesdQ8K2P6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
RfesdQ8K2P6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,04■■□□□ 1,44
RfesdQ8K2P6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
RfesdQ8K2P6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1,43
RfesdQ8K2P6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23,98■■□□□ 1,43
RfesdQ8K2P6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23,96■■□□□ 1,43
RfesdQ8K2P6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23,96■■□□□ 1,43
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