Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0P3

Tldc1, TLD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tldc1Q8K0P3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tldc1Q8K0P3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tldc1Q8K0P3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tldc1Q8K0P3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Tldc1Q8K0P3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tldc1Q8K0P3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tldc1Q8K0P3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tldc1Q8K0P3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tldc1Q8K0P3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tldc1Q8K0P3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tldc1Q8K0P3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tldc1Q8K0P3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tldc1Q8K0P3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tldc1Q8K0P3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tldc1Q8K0P3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tldc1Q8K0P3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tldc1Q8K0P3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tldc1Q8K0P3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tldc1Q8K0P3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tldc1Q8K0P3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tldc1Q8K0P3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tldc1Q8K0P3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tldc1Q8K0P3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tldc1Q8K0P3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tldc1Q8K0P3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tldc1Q8K0P3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tldc1Q8K0P3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tldc1Q8K0P3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tldc1Q8K0P3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tldc1Q8K0P3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tldc1Q8K0P3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tldc1Q8K0P3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tldc1Q8K0P3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tldc1Q8K0P3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tldc1Q8K0P3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tldc1Q8K0P3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tldc1Q8K0P3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tldc1Q8K0P3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Tldc1Q8K0P3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tldc1Q8K0P3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tldc1Q8K0P3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tldc1Q8K0P3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tldc1Q8K0P3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tldc1Q8K0P3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tldc1Q8K0P3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Tldc1Q8K0P3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Tldc1Q8K0P3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tldc1Q8K0P3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tldc1Q8K0P3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tldc1Q8K0P3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tldc1Q8K0P3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tldc1Q8K0P3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tldc1Q8K0P3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tldc1Q8K0P3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tldc1Q8K0P3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tldc1Q8K0P3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Tldc1Q8K0P3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tldc1Q8K0P3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tldc1Q8K0P3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tldc1Q8K0P3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tldc1Q8K0P3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tldc1Q8K0P3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tldc1Q8K0P3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Tldc1Q8K0P3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tldc1Q8K0P3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tldc1Q8K0P3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tldc1Q8K0P3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tldc1Q8K0P3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tldc1Q8K0P3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tldc1Q8K0P3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tldc1Q8K0P3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tldc1Q8K0P3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tldc1Q8K0P3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tldc1Q8K0P3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tldc1Q8K0P3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tldc1Q8K0P3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tldc1Q8K0P3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tldc1Q8K0P3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tldc1Q8K0P3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tldc1Q8K0P3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Tldc1Q8K0P3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Tldc1Q8K0P3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tldc1Q8K0P3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tldc1Q8K0P3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tldc1Q8K0P3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tldc1Q8K0P3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tldc1Q8K0P3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tldc1Q8K0P3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tldc1Q8K0P3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Tldc1Q8K0P3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Tldc1Q8K0P3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tldc1Q8K0P3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tldc1Q8K0P3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Tldc1Q8K0P3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tldc1Q8K0P3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tldc1Q8K0P3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tldc1Q8K0P3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tldc1Q8K0P3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tldc1Q8K0P3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tldc1Q8K0P3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms